29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2875 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  100 
 
 		 278 aa  558  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  100 
 
 		 278 aa  558  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  41.49 
 
 		 285 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  48.61 
 
 		 975 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  49.25 
 
 		 1457 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  49.25 
 
 		 3166 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  51.39 
 
 		 3295 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  47.76 
 
 		 3787 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  43.48 
 
 		 1013 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  46.48 
 
 		 2472 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  41.67 
 
 		 2532 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2324  hypothetical protein  26.44 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  39.73 
 
 		 551 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  51.52 
 
 		 551 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  43.02 
 
 		 647 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  47.3 
 
 		 645 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  49.37 
 
 		 613 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  46.75 
 
 		 760 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  46.58 
 
 		 582 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  52.78 
 
 		 636 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  44.16 
 
 		 580 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  37.61 
 
 		 615 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  45.68 
 
 		 448 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  40.54 
 
 		 487 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  53.03 
 
 		 590 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0196  pentapeptide repeat-containing protein  42.5 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  35.38 
 
 		 1029 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  47.06 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>