80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11839 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  100 
 
 
470 aa  923    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  49.89 
 
 
463 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  48.72 
 
 
409 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  47.06 
 
 
423 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  57.21 
 
 
385 aa  203  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  55.96 
 
 
406 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  42.06 
 
 
380 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  44.16 
 
 
403 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  43.57 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  58.6 
 
 
350 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  45.56 
 
 
396 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  37.91 
 
 
391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  46.88 
 
 
392 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  63.28 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  54.44 
 
 
382 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  60.26 
 
 
443 aa  166  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  60.8 
 
 
408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  60.54 
 
 
394 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  62.21 
 
 
423 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  40.46 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  44.32 
 
 
413 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  52.57 
 
 
760 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  56.04 
 
 
394 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  56.9 
 
 
1457 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  55.95 
 
 
3295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  53.57 
 
 
580 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  56.98 
 
 
391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  52.26 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  53.22 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  51.79 
 
 
409 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  54.44 
 
 
3166 aa  124  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  52.38 
 
 
582 aa  123  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  50.3 
 
 
655 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  34.56 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  51.45 
 
 
975 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  52.7 
 
 
645 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  36.63 
 
 
194 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  48.19 
 
 
487 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  52.26 
 
 
3787 aa  104  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  52.91 
 
 
1013 aa  103  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  51.95 
 
 
590 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  37.72 
 
 
173 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  36.36 
 
 
539 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  56.36 
 
 
2532 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  34.8 
 
 
445 aa  95.1  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  36.43 
 
 
540 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  48.82 
 
 
551 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  38.18 
 
 
518 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  33.2 
 
 
434 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  36.53 
 
 
556 aa  89  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  33.91 
 
 
435 aa  89  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  50.9 
 
 
479 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  42.02 
 
 
213 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  36.69 
 
 
176 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  34.1 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  36.31 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  36.31 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  36.31 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  42.2 
 
 
513 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  53.29 
 
 
636 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  34.94 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  35.33 
 
 
178 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  40.91 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  49.68 
 
 
615 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  37.8 
 
 
536 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  44.08 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  35.88 
 
 
439 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  37.93 
 
 
463 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  36.59 
 
 
496 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  54.29 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  41.22 
 
 
525 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  41.22 
 
 
525 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  41.22 
 
 
525 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  47.46 
 
 
185 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  49.31 
 
 
613 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  32.16 
 
 
452 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  32.16 
 
 
452 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  33.77 
 
 
450 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  37.76 
 
 
413 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  40.74 
 
 
315 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>