59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13458 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  358  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  78.98 
 
 
178 aa  278  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  67.05 
 
 
173 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  54.34 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  33.53 
 
 
194 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  34.52 
 
 
409 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  33.53 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  35.67 
 
 
406 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  37.65 
 
 
1457 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  33.93 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  35.62 
 
 
443 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  32.37 
 
 
392 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  31.33 
 
 
760 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  34.1 
 
 
391 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  36.69 
 
 
470 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  32.34 
 
 
385 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  33.33 
 
 
408 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  33.14 
 
 
394 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  32.24 
 
 
380 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  32.73 
 
 
487 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  30.23 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  28.16 
 
 
539 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  32.24 
 
 
423 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  33.33 
 
 
655 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  32.75 
 
 
975 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  35.57 
 
 
645 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  31.78 
 
 
346 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  33.9 
 
 
382 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  36.26 
 
 
393 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  32.21 
 
 
350 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  32.21 
 
 
350 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  33.56 
 
 
403 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  32.56 
 
 
391 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  31.21 
 
 
582 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  33.1 
 
 
413 aa  52  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  28.49 
 
 
435 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  28.49 
 
 
434 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  26.83 
 
 
445 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  27.65 
 
 
518 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  34.29 
 
 
3295 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  31.11 
 
 
463 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  31.79 
 
 
463 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  30.9 
 
 
448 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  34.25 
 
 
394 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  29.34 
 
 
391 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  28.74 
 
 
540 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  31.93 
 
 
580 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  25.45 
 
 
413 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  29.82 
 
 
409 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  36.11 
 
 
391 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  31.43 
 
 
513 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  33.13 
 
 
551 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  30.2 
 
 
525 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  30.2 
 
 
525 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  30.2 
 
 
525 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  33.08 
 
 
3166 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  25.88 
 
 
556 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  29.7 
 
 
368 aa  41.2  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  33.53 
 
 
1013 aa  40.8  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>