82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12379 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  100 
 
 		 613 aa  1106    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  73.84 
 
 		 615 aa  559  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  50.97 
 
 		 760 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  57.19 
 
 		 636 aa  415  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  52.88 
 
 		 645 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  54.4 
 
 		 582 aa  375  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  59.47 
 
 		 590 aa  369  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  54.88 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  52.82 
 
 		 3787 aa  276  8e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  49.57 
 
 		 975 aa  266  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  46.1 
 
 		 3295 aa  265  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  52.28 
 
 		 647 aa  249  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  48.49 
 
 		 551 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  51.61 
 
 		 3166 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  50.61 
 
 		 1457 aa  231  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  49.46 
 
 		 2532 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  52.67 
 
 		 2472 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  52.35 
 
 		 580 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  42.27 
 
 		 487 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  71.7 
 
 		 409 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  59.67 
 
 		 655 aa  140  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  47.06 
 
 		 1013 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  56.69 
 
 		 391 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  55.56 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  49.67 
 
 		 423 aa  115  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  51.77 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  55.56 
 
 		 350 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  39.93 
 
 		 380 aa  112  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  50.32 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  51.88 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  50.96 
 
 		 470 aa  108  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  41.09 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  53.9 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  56.95 
 
 		 408 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  40.1 
 
 		 392 aa  104  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  57.45 
 
 		 393 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  41.99 
 
 		 391 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  56.36 
 
 		 391 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  43.95 
 
 		 406 aa  90.5  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  55.48 
 
 		 423 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  56.95 
 
 		 463 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  52.23 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  57.14 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  47.92 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  40.19 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0216  pentapeptide repeat-containing protein  48.82 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0207  pentapeptide repeat-containing protein  48.82 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0196  pentapeptide repeat-containing protein  48.8 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  51.06 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  53.19 
 
 		 391 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  30.63 
 
 		 194 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  30.19 
 
 		 176 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  29.19 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  38.36 
 
 		 551 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  36.54 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  29.56 
 
 		 178 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  29.56 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  38.35 
 
 		 285 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  39.42 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  51.45 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  41.9 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  31.21 
 
 		 556 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  35.17 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  35.76 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  42.75 
 
 		 513 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  49.37 
 
 		 278 aa  53.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  49.37 
 
 		 278 aa  53.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  38.13 
 
 		 463 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  37.33 
 
 		 540 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  34.38 
 
 		 434 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  34.38 
 
 		 435 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  26.85 
 
 		 900 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  40.97 
 
 		 536 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1746  PE-PGRS family protein  47.43 
 
 		 248 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000877581  n/a   
 
 
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  24.82 
 
 		 734 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  35.17 
 
 		 439 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  38.75 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  38.75 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  38.75 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  25.42 
 
 		 401 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  25.42 
 
 		 401 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  36.77 
 
 		 368 aa  43.9  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>