49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5774 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  100 
 
 
413 aa  786    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  35.29 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  36.81 
 
 
760 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  32.72 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  26.2 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  34.67 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  29.76 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  34.62 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  47.3 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  41.67 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  34.15 
 
 
539 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  32.94 
 
 
435 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  28.37 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  27.03 
 
 
443 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  35.47 
 
 
423 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  37.5 
 
 
213 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  27.03 
 
 
443 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  26.69 
 
 
443 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  28.16 
 
 
392 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  27.81 
 
 
194 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  32.94 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  31.61 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  33.56 
 
 
975 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  45.45 
 
 
540 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  38.12 
 
 
655 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  48.08 
 
 
496 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  50 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  50 
 
 
350 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  46.3 
 
 
518 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  34.9 
 
 
645 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  32.21 
 
 
1457 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  31.51 
 
 
443 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  57.89 
 
 
524 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  35.4 
 
 
394 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  33.12 
 
 
487 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  34.48 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13927  PPE family protein  29.11 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  48 
 
 
315 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  58.33 
 
 
525 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  28.48 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  28.48 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  58.33 
 
 
525 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  58.33 
 
 
525 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  31.74 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  25.45 
 
 
176 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  25.64 
 
 
178 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  26.06 
 
 
439 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  35.43 
 
 
391 aa  43.1  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  48.84 
 
 
391 aa  43.1  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>