88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10769 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  100 
 
 
645 aa  1169    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  49.44 
 
 
760 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  53.75 
 
 
582 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  52.77 
 
 
636 aa  389  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  52.65 
 
 
615 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  51.81 
 
 
613 aa  333  5e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  52.45 
 
 
590 aa  326  9e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  50.19 
 
 
3787 aa  296  7e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  51.76 
 
 
551 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  50.5 
 
 
647 aa  262  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  40.23 
 
 
3295 aa  248  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  50 
 
 
2532 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  47.14 
 
 
448 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  43.46 
 
 
487 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  46.64 
 
 
1457 aa  220  7e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  45.9 
 
 
3166 aa  200  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  48.75 
 
 
580 aa  198  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  48.59 
 
 
2472 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  43.56 
 
 
975 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  65.06 
 
 
655 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  62.5 
 
 
409 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  58.66 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  53.99 
 
 
423 aa  139  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  55.28 
 
 
409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  51.79 
 
 
1013 aa  132  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  56.46 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  56.98 
 
 
391 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  54.97 
 
 
403 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  49.03 
 
 
396 aa  123  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  53.25 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  49.09 
 
 
406 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  51.52 
 
 
385 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  54.36 
 
 
350 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  48.65 
 
 
391 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  54.36 
 
 
350 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  46.98 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  52.83 
 
 
470 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  54.36 
 
 
382 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  57.53 
 
 
393 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  55 
 
 
408 aa  105  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  54.84 
 
 
423 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  53.8 
 
 
463 aa  101  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  53.42 
 
 
394 aa  101  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  33.92 
 
 
194 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  55.25 
 
 
479 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  44.34 
 
 
213 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  51.37 
 
 
391 aa  90.5  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  54.14 
 
 
394 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  34.76 
 
 
173 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  40.94 
 
 
346 aa  87  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  36 
 
 
178 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  34.15 
 
 
176 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  49.33 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  29.94 
 
 
180 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0196  pentapeptide repeat-containing protein  46.28 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  35.67 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0216  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 
316 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0207  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 
316 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  35.22 
 
 
556 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  35.8 
 
 
518 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  38.62 
 
 
285 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  36.48 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  31.87 
 
 
539 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  35.98 
 
 
434 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  35.98 
 
 
435 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  49.57 
 
 
185 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  35.5 
 
 
551 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  38.61 
 
 
513 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  34.84 
 
 
536 aa  57.4  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  34.9 
 
 
439 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  36.31 
 
 
463 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  36.11 
 
 
540 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  35.03 
 
 
368 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  32.26 
 
 
443 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  32.26 
 
 
443 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  32.26 
 
 
443 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  47.3 
 
 
278 aa  53.9  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  47.3 
 
 
278 aa  53.9  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  39.05 
 
 
413 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  39.39 
 
 
77 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5996  hypothetical protein  31.01 
 
 
455 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  25.71 
 
 
349 aa  49.3  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  37.25 
 
 
524 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  45.71 
 
 
265 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  36.08 
 
 
525 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  36.08 
 
 
525 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  36.08 
 
 
525 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  34.33 
 
 
496 aa  44.3  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>