86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12382 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  100 
 
 
615 aa  1094    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  74.17 
 
 
613 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  53.68 
 
 
760 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  58.82 
 
 
636 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  61.13 
 
 
590 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  50.87 
 
 
645 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  54.19 
 
 
582 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  55.4 
 
 
975 aa  352  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  55 
 
 
448 aa  296  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  52.54 
 
 
551 aa  294  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  45.19 
 
 
3295 aa  294  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  53.45 
 
 
3787 aa  264  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  52.76 
 
 
1457 aa  259  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  53.55 
 
 
3166 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  51.15 
 
 
647 aa  226  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  52.99 
 
 
2532 aa  219  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  38.68 
 
 
487 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  44.36 
 
 
580 aa  192  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  71.93 
 
 
409 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  50 
 
 
2472 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  59.69 
 
 
655 aa  161  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  57.21 
 
 
1013 aa  153  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  56.42 
 
 
391 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  51.22 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  56.69 
 
 
350 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  56.69 
 
 
350 aa  133  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  52.6 
 
 
443 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  53.18 
 
 
409 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  51.18 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  58.24 
 
 
408 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  54.55 
 
 
403 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  37.86 
 
 
380 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  46.29 
 
 
396 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  51.18 
 
 
470 aa  124  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  44.25 
 
 
392 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  45.26 
 
 
391 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  56.98 
 
 
391 aa  115  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  57.14 
 
 
393 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  44.71 
 
 
406 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  58.54 
 
 
463 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  54.44 
 
 
394 aa  106  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  55.35 
 
 
423 aa  105  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  48.41 
 
 
382 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  58.38 
 
 
479 aa  101  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  51.95 
 
 
394 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  53.9 
 
 
391 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  29.02 
 
 
194 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  51.63 
 
 
413 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0196  pentapeptide repeat-containing protein  47.41 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  36.75 
 
 
539 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  40.19 
 
 
213 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0216  pentapeptide repeat-containing protein  47.41 
 
 
316 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0207  pentapeptide repeat-containing protein  47.41 
 
 
316 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  30.18 
 
 
176 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  30 
 
 
178 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  29.24 
 
 
180 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  35.92 
 
 
285 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  37.74 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  36.84 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  29.59 
 
 
173 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  43.51 
 
 
551 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  31.58 
 
 
556 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  35.8 
 
 
518 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  37.16 
 
 
540 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  38.78 
 
 
463 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  40.22 
 
 
443 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  40.22 
 
 
443 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  40.22 
 
 
443 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  42.28 
 
 
513 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  35.4 
 
 
434 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  41.9 
 
 
413 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  35.4 
 
 
435 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  33.12 
 
 
445 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  40.65 
 
 
536 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  36.84 
 
 
439 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  38.06 
 
 
368 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  46.72 
 
 
185 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  37.01 
 
 
524 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  50 
 
 
278 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  50 
 
 
278 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  38.46 
 
 
525 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  38.46 
 
 
525 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  38.46 
 
 
525 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1746  PE-PGRS family protein  41.62 
 
 
248 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000877581  n/a   
 
 
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  34.32 
 
 
496 aa  44.3  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  25.47 
 
 
734 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>