80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13652 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  100 
 
 
413 aa  791    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  67.8 
 
 
409 aa  202  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  39.62 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  41.84 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  44.78 
 
 
392 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  42.51 
 
 
423 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  46.81 
 
 
403 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  38.67 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  42.09 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  42.7 
 
 
470 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  63.93 
 
 
350 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  63.93 
 
 
350 aa  179  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  47.92 
 
 
463 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  61.83 
 
 
394 aa  162  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  62.8 
 
 
443 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  56.11 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  54.07 
 
 
760 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  60 
 
 
391 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  40.53 
 
 
394 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  48.03 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  59.3 
 
 
423 aa  146  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  61.36 
 
 
393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  42.96 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  54.91 
 
 
580 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  53.71 
 
 
3295 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  54.02 
 
 
655 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  52.3 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  51.31 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  55.95 
 
 
3166 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  47.76 
 
 
582 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  50.29 
 
 
975 aa  119  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  46.29 
 
 
1457 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  49.68 
 
 
645 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  51.19 
 
 
409 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  41.23 
 
 
346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  54.19 
 
 
3787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  41.28 
 
 
443 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  41.28 
 
 
443 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  41.28 
 
 
443 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  53.01 
 
 
551 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  36.69 
 
 
194 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  41.49 
 
 
436 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  39.59 
 
 
445 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  50.6 
 
 
1013 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  51.59 
 
 
590 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  34.89 
 
 
556 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  42.11 
 
 
435 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  42.11 
 
 
434 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  38.51 
 
 
539 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  42.44 
 
 
368 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  55.36 
 
 
636 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  45.09 
 
 
513 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  41.88 
 
 
518 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  54.6 
 
 
2532 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  42.07 
 
 
439 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  45.1 
 
 
524 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  40.37 
 
 
540 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  55.03 
 
 
479 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  44.97 
 
 
525 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  44.97 
 
 
525 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  44.97 
 
 
525 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  43.92 
 
 
536 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  42.47 
 
 
463 aa  87  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  34.23 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  41.12 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  54.61 
 
 
647 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  48.45 
 
 
615 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  32.69 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  33.56 
 
 
178 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  41.04 
 
 
496 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  32.26 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  32.26 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  33.33 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  39.24 
 
 
450 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  50.93 
 
 
185 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  40 
 
 
413 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  47.95 
 
 
613 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  45.59 
 
 
77 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  45.83 
 
 
315 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  38.46 
 
 
385 aa  43.1  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>