82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12781 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  100 
 
 
394 aa  751    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  70.1 
 
 
391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  58.63 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  47.18 
 
 
409 aa  206  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  41.63 
 
 
385 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  43.8 
 
 
423 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  45.84 
 
 
403 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  41.85 
 
 
380 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  55.5 
 
 
406 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  41.62 
 
 
396 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  42.37 
 
 
470 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  38.83 
 
 
391 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  58.92 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  58.92 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  45.48 
 
 
463 aa  172  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  40.29 
 
 
392 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  44.33 
 
 
393 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  61.59 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  43.8 
 
 
408 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  42.58 
 
 
413 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  60.75 
 
 
394 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  40.91 
 
 
423 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  52.57 
 
 
760 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  47.73 
 
 
580 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  39.77 
 
 
391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  57.53 
 
 
391 aa  133  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  55.9 
 
 
3295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  55.84 
 
 
409 aa  123  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  53.69 
 
 
645 aa  123  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  48.85 
 
 
1457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  54.66 
 
 
3166 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  54.09 
 
 
487 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  46.67 
 
 
448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  52.38 
 
 
582 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  53.59 
 
 
655 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  54.55 
 
 
3787 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  50 
 
 
975 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  54.09 
 
 
551 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  33.23 
 
 
346 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  33.33 
 
 
194 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  53.61 
 
 
479 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  53.25 
 
 
590 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  40.12 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  40.12 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  37.72 
 
 
539 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  40.12 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  38.01 
 
 
445 aa  90.5  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  37.13 
 
 
436 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  32.96 
 
 
435 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  51.68 
 
 
2532 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  48.12 
 
 
1013 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  38.46 
 
 
439 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  35.37 
 
 
556 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  39.2 
 
 
540 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  45 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  36.24 
 
 
173 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  37.8 
 
 
518 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  39.46 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  36.51 
 
 
434 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  39.75 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  51.25 
 
 
636 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  42.86 
 
 
524 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  31.85 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  52.14 
 
 
647 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  40.12 
 
 
513 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  37.8 
 
 
536 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  34.21 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  40.13 
 
 
496 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  51.75 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  39.33 
 
 
525 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  39.33 
 
 
525 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  39.33 
 
 
525 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  38.31 
 
 
450 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  34.18 
 
 
452 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  34.18 
 
 
452 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  52.23 
 
 
615 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11058  PE family protein  40.7 
 
 
275 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12782  PE family protein  44.44 
 
 
275 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.45258  normal  0.270609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  51.39 
 
 
613 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  35.71 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  38.24 
 
 
77 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>