53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5559 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  100 
 
 
452 aa  887    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  100 
 
 
452 aa  887    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  50.79 
 
 
513 aa  156  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  47 
 
 
540 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  48.17 
 
 
525 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  48.17 
 
 
525 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  48.17 
 
 
525 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  47.62 
 
 
435 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  47.62 
 
 
434 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  48.85 
 
 
518 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  52.17 
 
 
524 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  47.13 
 
 
463 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  44.77 
 
 
556 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  51.16 
 
 
496 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  30.21 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  48.85 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  36.58 
 
 
443 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  36.58 
 
 
443 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  36.58 
 
 
443 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  40 
 
 
539 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  30.59 
 
 
439 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  36.45 
 
 
450 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  36.26 
 
 
368 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  29.68 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  50.65 
 
 
315 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  52.7 
 
 
77 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  27.52 
 
 
194 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  29.94 
 
 
396 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  32.41 
 
 
391 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  30.49 
 
 
423 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  33.14 
 
 
406 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  28.81 
 
 
392 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  33.56 
 
 
443 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  31.55 
 
 
385 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  28.87 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  30.2 
 
 
380 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  25.99 
 
 
346 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  32.05 
 
 
350 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  28.07 
 
 
391 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  31.43 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  31.08 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  33.65 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  32.05 
 
 
350 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  28.91 
 
 
213 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  30.46 
 
 
382 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  28.74 
 
 
1457 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  33.8 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  27.98 
 
 
760 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  31.48 
 
 
448 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  30.41 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  33.71 
 
 
413 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  32.16 
 
 
470 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  31.74 
 
 
394 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>