65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5459 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  100 
 
 
450 aa  874    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  47.27 
 
 
443 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  47.27 
 
 
443 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  47.27 
 
 
443 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  37.93 
 
 
436 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  39.94 
 
 
439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  51.12 
 
 
368 aa  151  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  37.05 
 
 
452 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  37.05 
 
 
452 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  37.95 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  33.44 
 
 
445 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  40.66 
 
 
434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  39.31 
 
 
539 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  43.72 
 
 
540 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  40 
 
 
518 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  47.17 
 
 
524 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  46.75 
 
 
525 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  46.75 
 
 
525 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  46.75 
 
 
525 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  39.61 
 
 
556 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  41.71 
 
 
536 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  44.19 
 
 
463 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  41.56 
 
 
513 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  40.57 
 
 
496 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  39.88 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  37.65 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  38.57 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  37.25 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  40.54 
 
 
443 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  37.78 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  40.48 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  35.88 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  40.48 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  35.89 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  36.2 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  37.7 
 
 
385 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  38.82 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  36.11 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  52.46 
 
 
315 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  38.1 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  32 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  36.53 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  36.16 
 
 
760 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  38.65 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  34.55 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  38 
 
 
382 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  25.27 
 
 
194 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  38.71 
 
 
580 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  38.86 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  39.53 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  35.33 
 
 
470 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  38.78 
 
 
394 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  31.91 
 
 
448 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  36 
 
 
655 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  34.16 
 
 
3295 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  33.6 
 
 
3787 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  34.87 
 
 
409 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  33.33 
 
 
487 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  33.56 
 
 
645 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  33.33 
 
 
1457 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  38.3 
 
 
582 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  37.88 
 
 
590 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6401  hypothetical protein  25.4 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  31.9 
 
 
213 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  38.26 
 
 
391 aa  43.5  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>