66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12140 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  100 
 
 		 213 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  40.17 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  47.96 
 
 		 380 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  48.81 
 
 		 655 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  45.22 
 
 		 406 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  39.32 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  40.15 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  41.88 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  50 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  30.95 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  36.09 
 
 		 385 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  32.37 
 
 		 391 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  37.82 
 
 		 392 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  42.02 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  42.98 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  39.17 
 
 		 760 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  42.34 
 
 		 408 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  30.77 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  39.84 
 
 		 1457 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  44.79 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  44.79 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  29.66 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  30.23 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  44 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  40.16 
 
 		 443 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  44 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  33.94 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  43.24 
 
 		 403 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  33.85 
 
 		 443 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  33.85 
 
 		 443 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  33.85 
 
 		 443 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  35.34 
 
 		 435 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  43.43 
 
 		 487 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  34.75 
 
 		 434 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  44.12 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  29.46 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  40.34 
 
 		 580 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  34.34 
 
 		 556 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  33.05 
 
 		 518 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  40 
 
 		 413 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  44.12 
 
 		 391 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  37.4 
 
 		 393 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  39.8 
 
 		 2532 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  37.33 
 
 		 975 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  31.25 
 
 		 346 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  27.13 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  40.96 
 
 		 409 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  45.36 
 
 		 391 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  46.75 
 
 		 413 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  35.4 
 
 		 3166 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  44.44 
 
 		 513 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  31.67 
 
 		 496 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  32.35 
 
 		 368 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  38.94 
 
 		 3295 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  33.64 
 
 		 540 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  28.91 
 
 		 452 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  28.91 
 
 		 452 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  42.27 
 
 		 463 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  34.86 
 
 		 439 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  45.36 
 
 		 394 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  35 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  41.94 
 
 		 582 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  46.43 
 
 		 448 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  36.04 
 
 		 536 aa  41.6  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  42.59 
 
 		 479 aa  41.6  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  40.48 
 
 		 3787 aa  41.6  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>