72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12155 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  100 
 
 
496 aa  990    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  49.21 
 
 
556 aa  206  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  51.38 
 
 
434 aa  193  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  47.59 
 
 
518 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  50.97 
 
 
435 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  44.24 
 
 
540 aa  187  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  45.77 
 
 
513 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  44.24 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  59.2 
 
 
536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  44.7 
 
 
525 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  44.7 
 
 
525 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  44.7 
 
 
525 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  44.44 
 
 
524 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  46.67 
 
 
539 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  51.16 
 
 
452 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  51.16 
 
 
452 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  42.44 
 
 
436 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  41.85 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  41.85 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  41.85 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  39.04 
 
 
439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  45.51 
 
 
368 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  59.09 
 
 
315 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  38.65 
 
 
445 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  37.32 
 
 
380 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  40.91 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  36.9 
 
 
3295 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  57.33 
 
 
77 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  35.68 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  35.68 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  32.63 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  39.46 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  39.6 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  36.59 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  38.15 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  38.56 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  40 
 
 
391 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  38.62 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  38.22 
 
 
3166 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  37.72 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  35.29 
 
 
760 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  31.76 
 
 
194 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  38.92 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  37.36 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  37.85 
 
 
1457 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  38.92 
 
 
448 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  37.97 
 
 
580 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  36.67 
 
 
645 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  39.33 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  35.54 
 
 
487 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  39.07 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  40.14 
 
 
394 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  36.53 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  35.15 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  38.31 
 
 
409 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  35.95 
 
 
392 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  32.67 
 
 
346 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  38.04 
 
 
408 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  37.5 
 
 
582 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  36.13 
 
 
655 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  32.99 
 
 
3787 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  31.67 
 
 
213 aa  57  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  36.71 
 
 
975 aa  57  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  38.71 
 
 
1013 aa  57  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  37.79 
 
 
463 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  37.79 
 
 
391 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  38.33 
 
 
413 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  32.3 
 
 
551 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  35.19 
 
 
413 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  42.59 
 
 
590 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  28.4 
 
 
178 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  26.04 
 
 
176 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>