31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3860 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3860  pentapeptide repeat containing protein  100 
 
 		 285 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179261  normal  0.135456 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2875  pentapeptide repeat containing protein  41.49 
 
 		 278 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.88171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0811  pentapeptide repeat containing protein  41.49 
 
 		 278 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  60.24 
 
 		 3166 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  49.46 
 
 		 975 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  55.42 
 
 		 1457 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13380  PPE family protein  47.92 
 
 		 2472 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.21147  normal  0.142656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  53.75 
 
 		 3787 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  46.6 
 
 		 1013 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  51.11 
 
 		 2532 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  54.76 
 
 		 3295 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  53.75 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2324  hypothetical protein  31.66 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  35.66 
 
 		 615 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  40.3 
 
 		 582 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  45.28 
 
 		 551 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  47.19 
 
 		 647 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  38.62 
 
 		 645 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  45.56 
 
 		 636 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  38.35 
 
 		 613 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0207  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0216  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0196  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3068  hypothetical protein  34.43 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  40 
 
 		 590 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  44.57 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  44.83 
 
 		 760 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  34.65 
 
 		 580 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  37.62 
 
 		 487 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  37.84 
 
 		 971 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>