59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1609 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1609  protein splicing (intein) site  100 
 
 		 1137 aa  2359    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.395173 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1277  ribonucleotide reductase (class II)  79.55 
 
 		 784 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.699832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1200  ribonucleotide reductase (class II)  77.65 
 
 		 781 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20281  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07711  ribonucleotide reductase (class II)  75.63 
 
 		 779 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000571261 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0093  ribonucleotide reductase (class II)  75.14 
 
 		 778 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.126757  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07181  ribonucleotide reductase (class II)  74.86 
 
 		 778 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0617778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1670  RP ribonucleotide reductase-like  73.18 
 
 		 765 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461519  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14171  ribonucleotide reductase (class II)  74.86 
 
 		 804 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07141  ribonucleotide reductase (class II)  73.39 
 
 		 777 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07161  ribonucleotide reductase (class II)  73.11 
 
 		 777 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0661  ribonucleotide reductase (class II)  72.83 
 
 		 777 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07341  ribonucleotide reductase (class II)  72.27 
 
 		 777 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1083  hedgehog/intein hint domain-containing protein  66.55 
 
 		 1554 aa  402  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.210582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1269  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  43.45 
 
 		 1121 aa  382  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0309898  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2543  ribonucleoside reductase precursor  42.29 
 
 		 1317 aa  356  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0256  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.28 
 
 		 1089 aa  348  4e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.95152  normal  0.578606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4588  ribonucleoside reductase  50.13 
 
 		 1189 aa  347  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0667  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.88 
 
 		 1226 aa  345  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1471  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  37.72 
 
 		 1095 aa  338  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298183  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2673  Ribonucleoside-diphosphate reductase  45.34 
 
 		 1137 aa  331  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0267  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  36.18 
 
 		 1153 aa  318  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.249441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0425  protein splicing site  35.53 
 
 		 1985 aa  285  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902882 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  32.42 
 
 		 1416 aa  242  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0442  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.6 
 
 		 955 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3755  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  31.77 
 
 		 1184 aa  155  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.561834 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0703  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  29.41 
 
 		 1513 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1608  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.34 
 
 		 1240 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.863119 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1670  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.29 
 
 		 1240 aa  129  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.346391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2540  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  30.38 
 
 		 1354 aa  126  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0577  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.98 
 
 		 1521 aa  122  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.288814 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1025  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.67 
 
 		 1331 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0433  protein splicing site  62.35 
 
 		 85 aa  112  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0428  RP ribonucleotide reductase-like  62.5 
 
 		 93 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577818  normal  0.0267264 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1503  ribonucleotide reductase, alpha subunit  27.72 
 
 		 757 aa  100  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.409553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1513  truncated ribonucleoside-diphosphate reductase 2, alpha subunit  25.78 
 
 		 969 aa  99.4  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000128379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3326  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.65 
 
 		 1779 aa  89.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4766  ribonucleoside-triphosphate reductase  27.61 
 
 		 755 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  28.08 
 
 		 903 aa  82.8  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4577  ribonucleoside-triphosphate reductase  28.42 
 
 		 768 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0124  ribonucleoside-triphosphate reductase  27.72 
 
 		 769 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 1381 aa  76.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  26.96 
 
 		 1273 aa  75.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  29.93 
 
 		 945 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1788  ATP-cone domain-containing protein  27.75 
 
 		 842 aa  69.3  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  24.09 
 
 		 1272 aa  68.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  25.35 
 
 		 879 aa  67  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0007  DNA gyrase subunit A  26.43 
 
 		 1257 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231135  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0015  DNA gyrase subunit A  26.43 
 
 		 1257 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336793  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1586  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  22.5 
 
 		 1370 aa  62.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.945292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3507  ribonucleoside diphosphate reductase, B12-dependent  25.44 
 
 		 1281 aa  57  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.127912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5337  ribonucleoside-diphosphate reductase, alpha subunit  23.26 
 
 		 1123 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0821  DNA gyrase, A subunit  24.66 
 
 		 1261 aa  55.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308334  normal  0.183693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0007  DNA gyrase, A subunit  23.39 
 
 		 1262 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33290  ribonucleoside-diphosphate reductase, alpha subunit precursor  22.84 
 
 		 1338 aa  51.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  50 
 
 		 1098 aa  46.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1476  vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  42.11 
 
 		 1098 aa  45.8  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12750  DNA recombination protein RecA  25.36 
 
 		 790 aa  45.8  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000250397  normal  0.0414269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0803  DNA recombination protein RecA precursor  25.42 
 
 		 1177 aa  45.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106303  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  27.2 
 
 		 610 aa  44.7  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>