17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0428 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0428  RP ribonucleotide reductase-like  100 
 
 		 93 aa  191  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577818  normal  0.0267264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1670  RP ribonucleotide reductase-like  62.07 
 
 		 765 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461519  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1083  hedgehog/intein hint domain-containing protein  58.62 
 
 		 1554 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.210582  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1609  protein splicing (intein) site  62.5 
 
 		 1137 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.395173 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1200  ribonucleotide reductase (class II)  55.56 
 
 		 781 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20281  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0093  ribonucleotide reductase (class II)  57.95 
 
 		 778 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.126757  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07181  ribonucleotide reductase (class II)  56.82 
 
 		 778 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0617778 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14171  ribonucleotide reductase (class II)  55.68 
 
 		 804 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07711  ribonucleotide reductase (class II)  56.18 
 
 		 779 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000571261 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1277  ribonucleotide reductase (class II)  51.72 
 
 		 784 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.699832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07161  ribonucleotide reductase (class II)  49.41 
 
 		 777 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07141  ribonucleotide reductase (class II)  49.41 
 
 		 777 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0661  ribonucleotide reductase (class II)  48.24 
 
 		 777 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07341  ribonucleotide reductase (class II)  48.84 
 
 		 777 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1503  ribonucleotide reductase, alpha subunit  33.87 
 
 		 757 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.409553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0124  ribonucleoside-triphosphate reductase  40 
 
 		 769 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4577  ribonucleoside-triphosphate reductase  40 
 
 		 768 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>