31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_1083 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1083  hedgehog/intein hint domain-containing protein  100 
 
 
1554 aa  3249    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.210582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0425  protein splicing site  59.35 
 
 
1985 aa  924    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1670  RP ribonucleotide reductase-like  85.82 
 
 
765 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461519  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07711  ribonucleotide reductase (class II)  63.92 
 
 
779 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000571261 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1277  ribonucleotide reductase (class II)  64 
 
 
784 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.699832  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1609  protein splicing (intein) site  66.55 
 
 
1137 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.395173 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07161  ribonucleotide reductase (class II)  63.27 
 
 
777 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0093  ribonucleotide reductase (class II)  64 
 
 
778 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.126757  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07141  ribonucleotide reductase (class II)  62.91 
 
 
777 aa  383  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07181  ribonucleotide reductase (class II)  64 
 
 
778 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0617778 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07341  ribonucleotide reductase (class II)  63.27 
 
 
777 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0661  ribonucleotide reductase (class II)  62.55 
 
 
777 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14171  ribonucleotide reductase (class II)  59.79 
 
 
804 aa  376  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1200  ribonucleotide reductase (class II)  64.73 
 
 
781 aa  369  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20281  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0433  protein splicing site  62.79 
 
 
85 aa  113  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0428  RP ribonucleotide reductase-like  58.62 
 
 
93 aa  109  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577818  normal  0.0267264 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1503  ribonucleotide reductase, alpha subunit  26.09 
 
 
757 aa  90.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.409553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1586  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.16 
 
 
1370 aa  79  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.945292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0124  ribonucleoside-triphosphate reductase  27.91 
 
 
769 aa  78.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4577  ribonucleoside-triphosphate reductase  27.59 
 
 
768 aa  75.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3326  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.02 
 
 
1779 aa  73.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4766  ribonucleoside-triphosphate reductase  28.52 
 
 
755 aa  71.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  26.46 
 
 
1273 aa  68.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  22.15 
 
 
898 aa  64.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1788  ATP-cone domain-containing protein  27.03 
 
 
842 aa  62.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1025  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  23.9 
 
 
1331 aa  58.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400039  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1670  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.26 
 
 
1240 aa  58.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.346391  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  22.69 
 
 
945 aa  53.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  21.67 
 
 
1416 aa  47  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  22.16 
 
 
1272 aa  47  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4372  XRE family transcriptional regulator  22.56 
 
 
1188 aa  45.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00730956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>