21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1277 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1670  RP ribonucleotide reductase-like  66.09 
 
 		 765 aa  1056    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461519  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07711  ribonucleotide reductase (class II)  77.63 
 
 		 779 aa  1292    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000571261 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07141  ribonucleotide reductase (class II)  71.59 
 
 		 777 aa  1197    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14171  ribonucleotide reductase (class II)  80.85 
 
 		 804 aa  1330    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07181  ribonucleotide reductase (class II)  76.33 
 
 		 778 aa  1267    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0617778 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07341  ribonucleotide reductase (class II)  70.82 
 
 		 777 aa  1196    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07161  ribonucleotide reductase (class II)  71.21 
 
 		 777 aa  1193    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0661  ribonucleotide reductase (class II)  71.08 
 
 		 777 aa  1191    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1277  ribonucleotide reductase (class II)  100 
 
 		 784 aa  1631    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.699832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1200  ribonucleotide reductase (class II)  88.02 
 
 		 781 aa  1425    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20281  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0093  ribonucleotide reductase (class II)  76.2 
 
 		 778 aa  1268    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.126757  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1609  protein splicing (intein) site  79.55 
 
 		 1137 aa  620  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.395173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1083  hedgehog/intein hint domain-containing protein  64 
 
 		 1554 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.210582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0425  protein splicing site  55.31 
 
 		 1985 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902882 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1503  ribonucleotide reductase, alpha subunit  24.59 
 
 		 757 aa  143  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.409553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4766  ribonucleoside-triphosphate reductase  22.83 
 
 		 755 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0124  ribonucleoside-triphosphate reductase  21.92 
 
 		 769 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4577  ribonucleoside-triphosphate reductase  22.27 
 
 		 768 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0433  protein splicing site  63.01 
 
 		 85 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1788  ATP-cone domain-containing protein  24.69 
 
 		 842 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0428  RP ribonucleotide reductase-like  51.72 
 
 		 93 aa  85.5  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577818  normal  0.0267264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>