21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_07711 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1670  RP ribonucleotide reductase-like  65.3 
 
 		 765 aa  1049    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461519  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07711  ribonucleotide reductase (class II)  100 
 
 		 779 aa  1623    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000571261 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07141  ribonucleotide reductase (class II)  73.56 
 
 		 777 aa  1216    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14171  ribonucleotide reductase (class II)  76.74 
 
 		 804 aa  1290    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07181  ribonucleotide reductase (class II)  78.12 
 
 		 778 aa  1305    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0617778 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07341  ribonucleotide reductase (class II)  73.43 
 
 		 777 aa  1222    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07161  ribonucleotide reductase (class II)  73.43 
 
 		 777 aa  1216    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0661  ribonucleotide reductase (class II)  72.79 
 
 		 777 aa  1204    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1277  ribonucleotide reductase (class II)  77.63 
 
 		 784 aa  1292    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.699832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1200  ribonucleotide reductase (class II)  76.22 
 
 		 781 aa  1246    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20281  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0093  ribonucleotide reductase (class II)  78.25 
 
 		 778 aa  1305    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.126757  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1609  protein splicing (intein) site  75.63 
 
 		 1137 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.395173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1083  hedgehog/intein hint domain-containing protein  63.92 
 
 		 1554 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.210582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0425  protein splicing site  58.37 
 
 		 1985 aa  263  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902882 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1503  ribonucleotide reductase, alpha subunit  24.7 
 
 		 757 aa  138  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.409553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4766  ribonucleoside-triphosphate reductase  22.66 
 
 		 755 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0124  ribonucleoside-triphosphate reductase  22.16 
 
 		 769 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4577  ribonucleoside-triphosphate reductase  22.22 
 
 		 768 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0433  protein splicing site  60.53 
 
 		 85 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0428  RP ribonucleotide reductase-like  56.18 
 
 		 93 aa  88.6  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577818  normal  0.0267264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1788  ATP-cone domain-containing protein  28.85 
 
 		 842 aa  78.2  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>