24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1670 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0093  ribonucleotide reductase (class II)  65.14 
 
 		 778 aa  1050    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.126757  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07711  ribonucleotide reductase (class II)  65.3 
 
 		 779 aa  1049    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000571261 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07141  ribonucleotide reductase (class II)  64.85 
 
 		 777 aa  1070    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14171  ribonucleotide reductase (class II)  65.75 
 
 		 804 aa  1061    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07181  ribonucleotide reductase (class II)  65.27 
 
 		 778 aa  1050    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0617778 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07341  ribonucleotide reductase (class II)  64.06 
 
 		 777 aa  1056    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07161  ribonucleotide reductase (class II)  64.99 
 
 		 777 aa  1071    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1670  RP ribonucleotide reductase-like  100 
 
 		 765 aa  1602    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461519  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1200  ribonucleotide reductase (class II)  65.08 
 
 		 781 aa  1029    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20281  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1277  ribonucleotide reductase (class II)  66.09 
 
 		 784 aa  1056    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.699832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0661  ribonucleotide reductase (class II)  64.32 
 
 		 777 aa  1063    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1609  protein splicing (intein) site  73.18 
 
 		 1137 aa  590  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.395173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1083  hedgehog/intein hint domain-containing protein  85.82 
 
 		 1554 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.210582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0425  protein splicing site  58.67 
 
 		 1985 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902882 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1503  ribonucleotide reductase, alpha subunit  25.07 
 
 		 757 aa  146  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.409553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4766  ribonucleoside-triphosphate reductase  24.76 
 
 		 755 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0124  ribonucleoside-triphosphate reductase  23.12 
 
 		 769 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4577  ribonucleoside-triphosphate reductase  23.9 
 
 		 768 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0428  RP ribonucleotide reductase-like  62.07 
 
 		 93 aa  111  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577818  normal  0.0267264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0433  protein splicing site  61.63 
 
 		 85 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1788  ATP-cone domain-containing protein  23.76 
 
 		 842 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0324  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25.27 
 
 		 866 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000374976  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_286  ribonucleotide reductase  25.27 
 
 		 761 aa  45.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000168014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0345  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25.27 
 
 		 761 aa  44.7  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00309044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>