22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_07161 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1670  RP ribonucleotide reductase-like  64.99 
 
 		 765 aa  1071    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461519  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07711  ribonucleotide reductase (class II)  73.43 
 
 		 779 aa  1216    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000571261 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07141  ribonucleotide reductase (class II)  98.58 
 
 		 777 aa  1597    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14171  ribonucleotide reductase (class II)  72.89 
 
 		 804 aa  1195    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07181  ribonucleotide reductase (class II)  74.81 
 
 		 778 aa  1244    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0617778 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07341  ribonucleotide reductase (class II)  92.79 
 
 		 777 aa  1527    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07161  ribonucleotide reductase (class II)  100 
 
 		 777 aa  1616    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0661  ribonucleotide reductase (class II)  98.07 
 
 		 777 aa  1592    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1277  ribonucleotide reductase (class II)  71.21 
 
 		 784 aa  1193    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.699832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1200  ribonucleotide reductase (class II)  72.04 
 
 		 781 aa  1186    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20281  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0093  ribonucleotide reductase (class II)  74.81 
 
 		 778 aa  1241    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.126757  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1609  protein splicing (intein) site  73.11 
 
 		 1137 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.395173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1083  hedgehog/intein hint domain-containing protein  63.27 
 
 		 1554 aa  385  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.210582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0425  protein splicing site  56.11 
 
 		 1985 aa  253  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902882 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1503  ribonucleotide reductase, alpha subunit  24.97 
 
 		 757 aa  174  5.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.409553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4766  ribonucleoside-triphosphate reductase  23.95 
 
 		 755 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0124  ribonucleoside-triphosphate reductase  22.87 
 
 		 769 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4577  ribonucleoside-triphosphate reductase  23.06 
 
 		 768 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1788  ATP-cone domain-containing protein  23.3 
 
 		 842 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0433  protein splicing site  55.13 
 
 		 85 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0428  RP ribonucleotide reductase-like  49.41 
 
 		 93 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577818  normal  0.0267264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2874  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25.54 
 
 		 747 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>