21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1200 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1670  RP ribonucleotide reductase-like  65.08 
 
 		 765 aa  1045    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461519  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07711  ribonucleotide reductase (class II)  76.22 
 
 		 779 aa  1262    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000571261 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07141  ribonucleotide reductase (class II)  72.16 
 
 		 777 aa  1204    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14171  ribonucleotide reductase (class II)  80.21 
 
 		 804 aa  1318    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07181  ribonucleotide reductase (class II)  77.51 
 
 		 778 aa  1266    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0617778 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07341  ribonucleotide reductase (class II)  70.75 
 
 		 777 aa  1191    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07161  ribonucleotide reductase (class II)  72.04 
 
 		 777 aa  1202    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0661  ribonucleotide reductase (class II)  71.39 
 
 		 777 aa  1196    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1277  ribonucleotide reductase (class II)  88.02 
 
 		 784 aa  1445    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.699832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1200  ribonucleotide reductase (class II)  100 
 
 		 781 aa  1628    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20281  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0093  ribonucleotide reductase (class II)  77.38 
 
 		 778 aa  1266    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.126757  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1609  protein splicing (intein) site  77.65 
 
 		 1137 aa  609  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.395173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1083  hedgehog/intein hint domain-containing protein  64.73 
 
 		 1554 aa  385  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.210582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0425  protein splicing site  54.22 
 
 		 1985 aa  255  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4766  ribonucleoside-triphosphate reductase  23.59 
 
 		 755 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1503  ribonucleotide reductase, alpha subunit  23.24 
 
 		 757 aa  137  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.409553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0124  ribonucleoside-triphosphate reductase  22.59 
 
 		 769 aa  124  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4577  ribonucleoside-triphosphate reductase  22.45 
 
 		 768 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1788  ATP-cone domain-containing protein  26.69 
 
 		 842 aa  107  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0433  protein splicing site  64.38 
 
 		 85 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0428  RP ribonucleotide reductase-like  55.56 
 
 		 93 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577818  normal  0.0267264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>