50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0425 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_1083  hedgehog/intein hint domain-containing protein  59.35 
 
 		 1554 aa  924    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.210582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0425  protein splicing site  100 
 
 		 1985 aa  4133    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1609  protein splicing (intein) site  35.53 
 
 		 1137 aa  285  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.395173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1670  RP ribonucleotide reductase-like  58.67 
 
 		 765 aa  268  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461519  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07711  ribonucleotide reductase (class II)  58.37 
 
 		 779 aa  263  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000571261 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07181  ribonucleotide reductase (class II)  57.73 
 
 		 778 aa  259  5e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0617778 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0093  ribonucleotide reductase (class II)  57.27 
 
 		 778 aa  258  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.126757  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1277  ribonucleotide reductase (class II)  55.31 
 
 		 784 aa  256  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.699832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1200  ribonucleotide reductase (class II)  54.22 
 
 		 781 aa  255  7e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20281  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14171  ribonucleotide reductase (class II)  56.56 
 
 		 804 aa  255  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0661  ribonucleotide reductase (class II)  56.11 
 
 		 777 aa  253  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07161  ribonucleotide reductase (class II)  56.11 
 
 		 777 aa  253  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07141  ribonucleotide reductase (class II)  56.11 
 
 		 777 aa  253  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07341  ribonucleotide reductase (class II)  55.66 
 
 		 777 aa  249  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0442  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  30.83 
 
 		 955 aa  154  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  30.66 
 
 		 1416 aa  147  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1269  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.86 
 
 		 1121 aa  125  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0309898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3755  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.59 
 
 		 1184 aa  122  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.561834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5337  ribonucleoside-diphosphate reductase, alpha subunit  28.77 
 
 		 1123 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0703  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  31.31 
 
 		 1513 aa  110  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0256  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.31 
 
 		 1089 aa  105  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.95152  normal  0.578606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0667  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.17 
 
 		 1226 aa  102  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606243 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1608  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.19 
 
 		 1240 aa  99.8  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.863119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2540  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.65 
 
 		 1354 aa  98.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2673  Ribonucleoside-diphosphate reductase  25.8 
 
 		 1137 aa  97.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0267  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.87 
 
 		 1153 aa  95.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.249441  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2543  ribonucleoside reductase precursor  25.42 
 
 		 1317 aa  92.4  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1670  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.88 
 
 		 1240 aa  92  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.346391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4588  ribonucleoside reductase  25.06 
 
 		 1189 aa  91.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1471  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.34 
 
 		 1095 aa  92  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298183  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0577  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  29.32 
 
 		 1521 aa  89.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.288814 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1025  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  23.78 
 
 		 1331 aa  84.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400039  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  25.9 
 
 		 1273 aa  78.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1586  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.99 
 
 		 1370 aa  72.4  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.945292  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1513  truncated ribonucleoside-diphosphate reductase 2, alpha subunit  23.96 
 
 		 969 aa  68.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000128379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3326  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.51 
 
 		 1779 aa  66.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4766  ribonucleoside-triphosphate reductase  27.6 
 
 		 755 aa  65.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 1381 aa  64.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  24.63 
 
 		 932 aa  62.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0124  ribonucleoside-triphosphate reductase  26.48 
 
 		 769 aa  60.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  23.86 
 
 		 945 aa  59.7  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4577  ribonucleoside-triphosphate reductase  24.2 
 
 		 768 aa  59.3  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  24.38 
 
 		 879 aa  52.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  22.9 
 
 		 1607 aa  52  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  24.85 
 
 		 898 aa  50.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0631  Hedgehog/intein hint domain protein  23.43 
 
 		 462 aa  47.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  23.81 
 
 		 1412 aa  47.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3251  Radical SAM domain protein  21.86 
 
 		 698 aa  46.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1889  DNA polymerase III, alpha subunit / intein  23.21 
 
 		 2684 aa  45.8  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1041  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.55 
 
 		 1225 aa  45.8  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.588089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>