More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1663 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1663  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1420  two component transcriptional regulator  93.16 
 
 		 234 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09491  two-component response regulator  88.7 
 
 		 234 aa  407  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.228862 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0637  two component transcriptional regulator  81.42 
 
 		 254 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10741  two-component response regulator  80.71 
 
 		 253 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.6748  normal  0.476157 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14691  two-component response regulator  80.71 
 
 		 254 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.132919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12041  two-component response regulator  83.12 
 
 		 245 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12191  two-component response regulator  84.58 
 
 		 245 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1124  two component transcriptional regulator  83.98 
 
 		 245 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.747385  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12201  two-component response regulator  84.07 
 
 		 245 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4398  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.184239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0851  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.0165752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  40.36 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2466  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.28267  hitchhiker  0.0000000000126243 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.65 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2789  winged helix family two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 256 aa  119  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2736  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00867541  hitchhiker  0.0000000494299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3375  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35.09 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1263  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  30.49 
 
 		 219 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1866  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  32.89 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.07 
 
 		 229 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2151  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  31.7 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  32.59 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.37 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2015  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.75 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 227 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2563  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.07 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.53 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2013  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  35.43 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1746  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000480188  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.47 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  31.96 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.68 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1791  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.506547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2804  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000183823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  31.96 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.6 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  33.19 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0675  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  0.0931169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  35.51 
 
 		 334 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1542  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3534  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  31.51 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.91 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1216  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  33.33 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  32.35 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1198  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 226 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  33.65 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2855  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  32.59 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1608  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  32.59 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  34.63 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  35.16 
 
 		 224 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.74 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2805  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.53 
 
 		 224 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>