More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1420 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1420  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  454  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1663  two component transcriptional regulator  93.16 
 
 		 255 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09491  two-component response regulator  89.38 
 
 		 234 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.228862 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14691  two-component response regulator  86.21 
 
 		 254 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.132919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10741  two-component response regulator  86.61 
 
 		 253 aa  387  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.6748  normal  0.476157 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0637  two component transcriptional regulator  85.78 
 
 		 254 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12041  two-component response regulator  85.59 
 
 		 245 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1124  two component transcriptional regulator  83.33 
 
 		 245 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.747385  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12191  two-component response regulator  82.91 
 
 		 245 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12201  two-component response regulator  82.91 
 
 		 245 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4398  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.184239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0851  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.0165752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2466  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.28267  hitchhiker  0.0000000000126243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  39.46 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.53 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 231 aa  122  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2789  winged helix family two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35.84 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1263  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2736  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00867541  hitchhiker  0.0000000494299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3375  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1866  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  32.74 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.77 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  33.04 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.51 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2151  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  31.7 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.4 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.72 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  29.68 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2015  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  47.33 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0824  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4783  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000784885  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.11 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4392  two component transcriptional regulator  33.92 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0025821  decreased coverage  0.00000564878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2013  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  34.53 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  33.63 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3534  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.33 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0675  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  0.0931169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4110  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  35.15 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  37.57 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.48 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  31.96 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.78 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.16 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.19 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  32.77 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  34.63 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  31.96 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1791  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.506547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  37.95 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 227 aa  104  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  33.19 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  37.92 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  33.65 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2563  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  35.47 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1659  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  34.12 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  31.51 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>