113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0279 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0279  HDIG domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  362  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000148406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0328  metal dependent phosphohydrolase  60.11 
 
 		 217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15740  metal dependent phosphohydrolase  56.83 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0272  metal dependent phosphohydrolase  55.74 
 
 		 183 aa  213  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00103666  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0145  metal dependent phosphohydrolase  55.19 
 
 		 183 aa  204  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1352  metal dependent phosphohydrolase  57.38 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00103581  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0547  HDIG domain-containing protein  53.55 
 
 		 183 aa  190  9e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2109  metal dependent phosphohydrolase  57.46 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00149234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0723  metal dependent phosphohydrolase  53.01 
 
 		 180 aa  187  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1221  metal dependent phosphohydrolase  51.37 
 
 		 182 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0523  metal dependent phosphohydrolase  51.91 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1488  metal dependent phosphohydrolase  52.46 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1234  metal dependent phosphohydrolase  51.41 
 
 		 175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2011  metal dependent phosphohydrolase  49.73 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000379503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_488  HD superfamily hydrolase  51.91 
 
 		 183 aa  181  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0853951  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1325  metal dependent phosphohydrolase  46.45 
 
 		 180 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1635  metal dependent phosphohydrolase  47.54 
 
 		 181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0761  metal dependent phosphohydrolase  46.74 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.933081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1412  metal dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0296584 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0027  metal dependent phophohydrolase  44.57 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0010  metal dependent phosphohydrolase  45.6 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1169  metal dependent phosphohydrolase  41.85 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2258  metal dependent phosphohydrolase  41.3 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331666  hitchhiker  0.000431176 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1974  metal dependent phosphohydrolase  44.02 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475926  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2951  metal dependent phosphohydrolase  41.85 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1569  metal dependent phophohydrolase  39.46 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3835  metal dependent phophohydrolase  39.57 
 
 		 216 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3779  metal dependent phosphohydrolase  39.57 
 
 		 218 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0422  metal dependent phosphohydrolase  40.88 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2682  metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 		 190 aa  121  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0703847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3919  metal dependent phophohydrolase  39.04 
 
 		 214 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300311  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2145  metal dependent phosphohydrolase  42.2 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0703  metal dependent phophohydrolase  38.38 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000160771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0692  metal dependent phophohydrolase  36.96 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000253532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2783  HDIG domain-containing protein  38.1 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2252  metal dependent phosphohydrolase  36.93 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0289443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0374  metal dependent phosphohydrolase  43.17 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1079  metal dependent phosphohydrolase  41.3 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1591  hypothetical protein  40.76 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1422  metal dependent phosphohydrolase  40.44 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3897  metal dependent phophohydrolase  35.29 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0567621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3414  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014123 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1228  hypothetical protein  33.15 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3535  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0373  metal dependent phophohydrolase  39.77 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196484  normal  0.0301256 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1546  metal dependent phophohydrolase  39.2 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01460  predicted HD superfamily hydrolase  34.76 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0275977  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0463  metal dependent phosphohydrolase  39.2 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3456  metal dependent phophohydrolase  31.86 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.986512  normal  0.0301443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4403  metal dependent phophohydrolase  29.9 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.127842  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3184  metal dependent phophohydrolase  33.68 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2830  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4580  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000627017  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2818  HDIG domain-containing protein  36.02 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0140878 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1236  metal dependent phophohydrolase  33.33 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5425  metal dependent phophohydrolase  34.76 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0190213 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  33.33 
 
 		 771 aa  74.3  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3125  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572222 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  32.4 
 
 		 487 aa  55.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  33.67 
 
 		 519 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  29.79 
 
 		 518 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  32.32 
 
 		 521 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  32.32 
 
 		 519 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  31.63 
 
 		 527 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  30.3 
 
 		 520 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 		 487 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1043  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 		 488 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.862003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  30.86 
 
 		 395 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  27.12 
 
 		 533 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  31.63 
 
 		 519 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  27.12 
 
 		 533 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 525 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1425  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 		 514 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.340697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1240  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  29.29 
 
 		 521 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 		 719 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  30.5 
 
 		 517 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  29.29 
 
 		 520 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  30.3 
 
 		 520 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  29.29 
 
 		 521 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  35.29 
 
 		 519 aa  44.7  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0283  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 		 523 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333798  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3057  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 189 aa  44.7  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000330579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  31.31 
 
 		 522 aa  44.7  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  32.06 
 
 		 513 aa  44.7  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0550  phosphodiesterase  33.77 
 
 		 509 aa  44.7  0.0009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  30.61 
 
 		 519 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4229  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000705206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4067  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02147e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4077  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000820217  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4557  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000033542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  32.93 
 
 		 510 aa  43.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4353  conserved hypothetical protein TIGR00488  27.27 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00616609 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 		 518 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 517 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 		 558 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4464  conserved hypothetical protein TIGR00488  25 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000106842  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 		 509 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  30.3 
 
 		 522 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 		 520 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>