78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1240 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1240  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
189 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1251  metal dependent phosphohydrolase  46.2 
 
 
192 aa  186  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000664219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2111  metal dependent phosphohydrolase  49.45 
 
 
190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0964689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2379  HD domain-containing protein  44.68 
 
 
189 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2455  metal dependent phosphohydrolase  49.13 
 
 
192 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000047472  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2091  HD domain-containing protein  44.15 
 
 
189 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0509907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2517  metal dependent phosphohydrolase  46.2 
 
 
193 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000757991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0786  hypothetical protein TIGR00488  47.16 
 
 
189 aa  168  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108111  hitchhiker  0.00000158399 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4451  conserved hypothetical protein TIGR00488  47.16 
 
 
189 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0996  metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 
192 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1602  metal dependent phosphohydrolase  43.17 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000171487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3057  metal dependent phosphohydrolase  45.09 
 
 
189 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000330579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4077  hypothetical protein  46.59 
 
 
245 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000820217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2014  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 
195 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4353  conserved hypothetical protein TIGR00488  46.59 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00616609 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4229  hypothetical protein  46.59 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000705206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4557  hypothetical protein  46.59 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000033542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4067  hypothetical protein  46.59 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02147e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4412  hypothetical protein  46.02 
 
 
189 aa  160  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1364  metal dependent phosphohydrolase  44.57 
 
 
190 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4464  conserved hypothetical protein TIGR00488  46.02 
 
 
189 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000106842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4182  metal dependent phosphohydrolase  46.82 
 
 
189 aa  158  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00037025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13400  metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
189 aa  158  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.852112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3308  metal dependent phosphohydrolase  41.99 
 
 
193 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000253484  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1582  HD superfamily hydrolase  40.88 
 
 
196 aa  149  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000492911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0534  metal dependent phosphohydrolase  37.64 
 
 
199 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.452404  normal  0.466553 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1160  hypothetical protein  41.85 
 
 
194 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1650  hypothetical protein  42.39 
 
 
194 aa  147  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1685  metal-dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 
194 aa  147  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1661  hypothetical protein  42.78 
 
 
195 aa  142  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.181137  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2545  metal dependent phosphohydrolase  42.77 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0290719  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0932  metal dependent phosphohydrolase  41.85 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0452437  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0232  HD superfamily hydrolase  38.59 
 
 
196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3117  metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 
206 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1782  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
194 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0566  metal dependent phosphohydrolase  46.29 
 
 
191 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3003  metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1402  HD superfamily NAD metabolism hydrolase  39.78 
 
 
210 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595747  hitchhiker  1.0312e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1234  metal dependent phosphohydrolase  39.15 
 
 
204 aa  132  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000446214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4551  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2559  metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 
200 aa  127  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00781757  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0772  metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 
194 aa  124  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0712  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 
189 aa  124  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2007  metal dependent phosphohydrolase  37.23 
 
 
207 aa  121  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00233087  hitchhiker  0.00000000000438339 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1181  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1143  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0342  metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 
189 aa  114  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0305391  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1737  HD superfamily NAD metabolism hydrolase  34.57 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4330  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 
192 aa  111  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.42032e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1747  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  38.07 
 
 
407 aa  108  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0909  HD superfamily NAD metabolism hydrolase  33.88 
 
 
189 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0353677  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0685  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
212 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000109701  normal  0.0222336 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06000  conserved hypothetical protein TIGR00488  35.29 
 
 
230 aa  102  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0573051  hitchhiker  0.0000000000805771 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13050  conserved hypothetical protein TIGR00488  33.15 
 
 
215 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.942626  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0133  metal dependent phosphohydrolase  35.47 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19839  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0707  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
192 aa  95.1  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0882  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0894  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  32.04 
 
 
375 aa  94.4  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0753  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00455309  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0228  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000811799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2795  hypothetical protein TIGR00488  36.75 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.57539  hitchhiker  0.00000474293 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf187  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  28.14 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000620739  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2229  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00246967  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0529  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  31.58 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0318554  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl373  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  30.13 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000405157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2565  hypothetical protein  36.28 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0212551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1816  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2527  conserved hypothetical protein TIGR00488  34.86 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2575  conserved hypothetical protein TIGR00488  33.63 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000155041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2386  hypothetical protein  33.63 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.700545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2342  HAD superfamily hydrolase  34.51 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000394388  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2562  hypothetical protein  33.63 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.920482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2618  conserved hypothetical protein TIGR00488  33.63 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0735814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2303  HAD superfamily hydrolase  32.74 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.466568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3989  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.347479  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2074  HD superfamily hydrolase  30.28 
 
 
224 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.621625  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0526  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  28.76 
 
 
392 aa  57.4  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.447363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0279  HDIG domain-containing protein  35.09 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000148406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>