60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0422 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0422  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2951  metal dependent phosphohydrolase  66.67 
 
 
189 aa  240  9e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2258  metal dependent phosphohydrolase  56.59 
 
 
186 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331666  hitchhiker  0.000431176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1079  metal dependent phosphohydrolase  59.78 
 
 
196 aa  203  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1412  metal dependent phosphohydrolase  53.8 
 
 
191 aa  201  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0296584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4403  metal dependent phophohydrolase  48.08 
 
 
213 aa  187  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.127842  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3535  metal dependent phosphohydrolase  50.81 
 
 
199 aa  184  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3456  metal dependent phophohydrolase  48.11 
 
 
213 aa  184  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.986512  normal  0.0301443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3414  metal dependent phosphohydrolase  47.8 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.014123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2830  metal dependent phosphohydrolase  52.84 
 
 
193 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2145  metal dependent phosphohydrolase  55.62 
 
 
187 aa  167  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0010  metal dependent phosphohydrolase  53.37 
 
 
190 aa  166  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3779  metal dependent phosphohydrolase  47.42 
 
 
218 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3835  metal dependent phophohydrolase  47.87 
 
 
216 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3897  metal dependent phophohydrolase  49.21 
 
 
224 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0567621 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3919  metal dependent phophohydrolase  46.81 
 
 
214 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2783  HDIG domain-containing protein  48.11 
 
 
191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0703  metal dependent phophohydrolase  47.03 
 
 
191 aa  154  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000160771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0692  metal dependent phophohydrolase  45.95 
 
 
191 aa  153  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000253532  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1569  metal dependent phophohydrolase  44.86 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0328  metal dependent phosphohydrolase  44.75 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15740  metal dependent phosphohydrolase  40.33 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329898  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0723  metal dependent phosphohydrolase  40.44 
 
 
180 aa  129  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1221  metal dependent phosphohydrolase  41.08 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0272  metal dependent phosphohydrolase  41.99 
 
 
183 aa  127  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00103666  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2682  metal dependent phosphohydrolase  43.96 
 
 
190 aa  125  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0703847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1234  metal dependent phosphohydrolase  40.45 
 
 
175 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0279  HDIG domain-containing protein  40.88 
 
 
183 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000148406  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1488  metal dependent phosphohydrolase  40.96 
 
 
183 aa  122  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1325  metal dependent phosphohydrolase  39.44 
 
 
180 aa  121  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0761  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.933081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0145  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 
183 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1169  metal dependent phosphohydrolase  39.36 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1352  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00103581  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0547  HDIG domain-containing protein  39.66 
 
 
183 aa  114  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5425  metal dependent phophohydrolase  46.52 
 
 
189 aa  114  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0190213 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4580  metal dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 
200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000627017  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01460  predicted HD superfamily hydrolase  38.46 
 
 
200 aa  112  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0275977  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3184  metal dependent phophohydrolase  39.89 
 
 
186 aa  111  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2011  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
183 aa  110  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000379503  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1635  metal dependent phosphohydrolase  36.96 
 
 
181 aa  108  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3125  metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 
181 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0572222 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_488  HD superfamily hydrolase  39.11 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0853951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2109  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 
185 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00149234  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0523  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 
183 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1974  metal dependent phosphohydrolase  41.08 
 
 
184 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475926  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0027  metal dependent phophohydrolase  36.46 
 
 
184 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1422  metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1236  metal dependent phophohydrolase  39.66 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2818  HDIG domain-containing protein  40 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0140878 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1591  hypothetical protein  37.63 
 
 
187 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  35.8 
 
 
771 aa  84.7  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0374  metal dependent phosphohydrolase  38.82 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1228  hypothetical protein  32.78 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0373  metal dependent phophohydrolase  33.52 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196484  normal  0.0301256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2252  metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0289443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1546  metal dependent phophohydrolase  32.95 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0463  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  33.33 
 
 
546 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 
1073 aa  41.2  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>