58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1236 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1236  metal dependent phophohydrolase  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3184  metal dependent phophohydrolase  74.58 
 
 
186 aa  294  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01460  predicted HD superfamily hydrolase  51.91 
 
 
200 aa  190  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0275977  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2682  metal dependent phosphohydrolase  55.11 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0703847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0692  metal dependent phophohydrolase  47.16 
 
 
191 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000253532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0703  metal dependent phophohydrolase  46.59 
 
 
191 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000160771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2783  HDIG domain-containing protein  47.73 
 
 
191 aa  178  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2818  HDIG domain-containing protein  54.1 
 
 
201 aa  175  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0140878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4580  metal dependent phosphohydrolase  50.57 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000627017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1569  metal dependent phophohydrolase  45.51 
 
 
184 aa  166  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.67 
 
 
771 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3897  metal dependent phophohydrolase  42.13 
 
 
224 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0567621 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2258  metal dependent phosphohydrolase  43.96 
 
 
186 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331666  hitchhiker  0.000431176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1412  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0296584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3779  metal dependent phosphohydrolase  40.45 
 
 
218 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3919  metal dependent phophohydrolase  39.33 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300311  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2951  metal dependent phosphohydrolase  44.69 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3835  metal dependent phophohydrolase  38.76 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3535  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0010  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3414  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
212 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.014123 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1079  metal dependent phosphohydrolase  44.29 
 
 
196 aa  112  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2145  metal dependent phosphohydrolase  36.78 
 
 
187 aa  111  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0422  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1221  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1325  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 
180 aa  107  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2830  metal dependent phosphohydrolase  42.42 
 
 
193 aa  104  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1234  metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 
175 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0272  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
183 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00103666  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0723  metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
180 aa  102  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0547  HDIG domain-containing protein  37.8 
 
 
183 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1635  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 
181 aa  100  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_488  HD superfamily hydrolase  37.2 
 
 
183 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0853951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1488  metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5425  metal dependent phophohydrolase  40 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0190213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15740  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
183 aa  99  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2011  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
183 aa  97.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000379503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4403  metal dependent phophohydrolase  32.18 
 
 
213 aa  97.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.127842  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0328  metal dependent phosphohydrolase  31.87 
 
 
217 aa  97.1  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0279  HDIG domain-containing protein  33.33 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000148406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0523  metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0463  metal dependent phosphohydrolase  38.64 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3456  metal dependent phophohydrolase  31.84 
 
 
213 aa  94.4  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.986512  normal  0.0301443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1352  metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00103581  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1546  metal dependent phophohydrolase  37.43 
 
 
187 aa  92  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0373  metal dependent phophohydrolase  38.64 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196484  normal  0.0301256 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1169  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0027  metal dependent phophohydrolase  35.67 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0145  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0761  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.933081 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3125  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0572222 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1974  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475926  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1228  hypothetical protein  30.63 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2109  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00149234  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1422  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1591  hypothetical protein  32.42 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2252  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0289443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0374  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>