62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0547 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0547  HDIG domain-containing protein  100 
 
 
183 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_488  HD superfamily hydrolase  93.99 
 
 
183 aa  343  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0853951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0523  metal dependent phosphohydrolase  86.89 
 
 
183 aa  330  8e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15740  metal dependent phosphohydrolase  53.01 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0272  metal dependent phosphohydrolase  51.91 
 
 
183 aa  194  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00103666  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0328  metal dependent phosphohydrolase  51.91 
 
 
217 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0279  HDIG domain-containing protein  53.55 
 
 
183 aa  190  9e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000148406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0145  metal dependent phosphohydrolase  51.37 
 
 
183 aa  187  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2011  metal dependent phosphohydrolase  48.09 
 
 
183 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000379503  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1325  metal dependent phosphohydrolase  49.18 
 
 
180 aa  181  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2109  metal dependent phosphohydrolase  51.93 
 
 
185 aa  177  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00149234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0723  metal dependent phosphohydrolase  48.63 
 
 
180 aa  175  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1221  metal dependent phosphohydrolase  47.54 
 
 
182 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1234  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
175 aa  169  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1488  metal dependent phosphohydrolase  49.73 
 
 
183 aa  167  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1352  metal dependent phosphohydrolase  45.9 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00103581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1412  metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0296584 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1635  metal dependent phosphohydrolase  38.8 
 
 
181 aa  136  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2258  metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 
186 aa  135  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331666  hitchhiker  0.000431176 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0027  metal dependent phophohydrolase  40.76 
 
 
184 aa  134  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1169  metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2951  metal dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0692  metal dependent phophohydrolase  39.13 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000253532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0761  metal dependent phosphohydrolase  41.3 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.933081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0703  metal dependent phophohydrolase  39.13 
 
 
191 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000160771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0374  metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 
184 aa  120  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1569  metal dependent phophohydrolase  35.68 
 
 
184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2145  metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 
187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2783  HDIG domain-containing protein  40.57 
 
 
191 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1974  metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 
184 aa  117  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475926  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1079  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0422  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
188 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01460  predicted HD superfamily hydrolase  37.16 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0275977  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3414  metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.014123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4580  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000627017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2252  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
182 aa  111  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0289443  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1422  metal dependent phosphohydrolase  39.52 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3779  metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 
218 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2682  metal dependent phosphohydrolase  39.25 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0703847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3919  metal dependent phophohydrolase  37.57 
 
 
214 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3184  metal dependent phophohydrolase  40.37 
 
 
186 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3835  metal dependent phophohydrolase  36.99 
 
 
216 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1591  hypothetical protein  39.88 
 
 
187 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2818  HDIG domain-containing protein  38.38 
 
 
201 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0140878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0010  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
190 aa  101  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2830  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
193 aa  97.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1228  hypothetical protein  32.61 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3456  metal dependent phophohydrolase  31.68 
 
 
213 aa  94  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.986512  normal  0.0301443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3897  metal dependent phophohydrolase  32.76 
 
 
224 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0567621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3535  metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 
199 aa  91.3  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4403  metal dependent phophohydrolase  29.7 
 
 
213 aa  88.2  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.127842  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1236  metal dependent phophohydrolase  37.8 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0373  metal dependent phophohydrolase  37.97 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196484  normal  0.0301256 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0463  metal dependent phosphohydrolase  35.76 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1546  metal dependent phophohydrolase  37.75 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  36.81 
 
 
771 aa  81.3  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5425  metal dependent phophohydrolase  34.74 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0190213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3125  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0572222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  28.57 
 
 
527 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  27.21 
 
 
507 aa  42  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0748  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
187 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.663055  normal  0.257153 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  27.21 
 
 
507 aa  42  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>