67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5349 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5349  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1697  hypothetical protein  58.39 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1887  hypothetical protein  55.28 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.645116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1145  hypothetical protein  46.58 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0878  hypothetical protein  51.09 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.337584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1999  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0935237  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4128  hypothetical protein  53.28 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6412  protein of unknown function DUF1452  56.48 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3960  hypothetical protein  46.62 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6107  protein of unknown function DUF1452  56.48 
 
 		 146 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3342  hypothetical protein  51.56 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6243  hypothetical protein  52.63 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.186882  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6293  protein of unknown function DUF1452  51.79 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4180  hypothetical protein  52.38 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1801  hypothetical protein  45.45 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.611763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4091  hypothetical protein  52.63 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1265  hypothetical protein  51.4 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0835472  normal  0.0149766 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4384  hypothetical protein  42.11 
 
 		 151 aa  114  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4801  protein of unknown function DUF1452  60.78 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6172  protein of unknown function DUF1452  55.68 
 
 		 153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.714343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6346  hypothetical protein  40.58 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4617  hypothetical protein  58.49 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1416  protein of unknown function DUF1452  38.46 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534453  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0387  protein of unknown function DUF1452  48.11 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1464  protein of unknown function DUF1452  46.34 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136392  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2666  hypothetical protein  45.79 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.805383  normal  0.0712153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2131  protein of unknown function DUF1452  44.95 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7034  protein of unknown function DUF1452  50.45 
 
 		 132 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4800  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.060799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1922  protein of unknown function DUF1452  39.68 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.829708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3113  hypothetical protein  43.81 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5514  hypothetical protein  38.89 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2994  hypothetical protein  47.62 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2040  protein of unknown function DUF1452  33.93 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  hitchhiker  0.00000004255 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6797  hypothetical protein  40.94 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4318  hypothetical protein  38.33 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2012  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1925  hypothetical protein  52.13 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0450  hypothetical protein  48.94 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2630  hypothetical protein  41.9 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  0.332594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0272  hypothetical protein  53.49 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0079  protein of unknown function DUF1452  38.89 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.469341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2306  hypothetical protein  50.57 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00866785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5867  hypothetical protein  37.59 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0988  protein of unknown function DUF1452  42.16 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6150  hypothetical protein  32.7 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374838  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0074  hypothetical protein  38.33 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.809247  hitchhiker  0.00118298 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0402  hypothetical protein  38.6 
 
 		 332 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36360  hypothetical protein  48.24 
 
 		 140 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190615  normal  0.857259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1288  hypothetical protein  32.08 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71134  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6543  hypothetical protein  32.08 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.687161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3464  protein of unknown function DUF1452  50 
 
 		 140 aa  97.1  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1963  hypothetical protein  37.72 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1870  hypothetical protein  37.72 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.346041  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6778  protein of unknown function DUF1452  35.88 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1325  hypothetical protein  45.19 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2859  protein of unknown function DUF1452  46.24 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.471643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2766  protein of unknown function DUF1452  46.24 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8259  protein of unknown function DUF1452  50 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.653302  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5070  hypothetical protein  45.28 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2590  protein of unknown function DUF1452  54.55 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2673  hypothetical protein  45.65 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2181  hypothetical protein  51.67 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3461  protein of unknown function DUF1452  34.19 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126188  hitchhiker  0.000453581 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4842  hypothetical protein  33.94 
 
 		 119 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0133702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3036  hypothetical protein  58.14 
 
 		 46 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367965  normal  0.733204 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5831  protein of unknown function DUF1452  28.12 
 
 		 106 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>