67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4128 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4128  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1145  hypothetical protein  62.73 
 
 		 162 aa  207  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3960  hypothetical protein  67.86 
 
 		 159 aa  207  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3342  hypothetical protein  71.94 
 
 		 154 aa  190  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6107  protein of unknown function DUF1452  61.36 
 
 		 146 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6412  protein of unknown function DUF1452  58.96 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6243  hypothetical protein  63.89 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.186882  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1887  hypothetical protein  59.83 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.645116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1697  hypothetical protein  62.16 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4180  hypothetical protein  61.11 
 
 		 143 aa  144  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6293  protein of unknown function DUF1452  59.83 
 
 		 148 aa  137  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1265  hypothetical protein  47.59 
 
 		 162 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0835472  normal  0.0149766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4617  hypothetical protein  63.21 
 
 		 166 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5349  hypothetical protein  53.28 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1801  hypothetical protein  52.85 
 
 		 136 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.611763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2666  hypothetical protein  51.24 
 
 		 131 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.805383  normal  0.0712153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4801  protein of unknown function DUF1452  64.71 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0988  protein of unknown function DUF1452  45.45 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4091  hypothetical protein  49.61 
 
 		 142 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1922  protein of unknown function DUF1452  53.4 
 
 		 159 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.829708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0387  protein of unknown function DUF1452  52.25 
 
 		 189 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2131  protein of unknown function DUF1452  53.4 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6346  hypothetical protein  52.94 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6172  protein of unknown function DUF1452  53.91 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.714343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0878  hypothetical protein  57.14 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.337584 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6150  hypothetical protein  45.52 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374838  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4318  hypothetical protein  51.3 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4384  hypothetical protein  50.98 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3113  hypothetical protein  43.31 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1963  hypothetical protein  48.25 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1870  hypothetical protein  48.25 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.346041  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0272  hypothetical protein  53.17 
 
 		 142 aa  122  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1288  hypothetical protein  44.03 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71134  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6543  hypothetical protein  44.03 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.687161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0402  hypothetical protein  47.37 
 
 		 332 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5867  hypothetical protein  49.54 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5514  hypothetical protein  42.38 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7034  protein of unknown function DUF1452  51.52 
 
 		 132 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1416  protein of unknown function DUF1452  50.88 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534453  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2040  protein of unknown function DUF1452  46.83 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  hitchhiker  0.00000004255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1999  hypothetical protein  46.49 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0935237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2994  hypothetical protein  44.6 
 
 		 148 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36360  hypothetical protein  47.97 
 
 		 140 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190615  normal  0.857259 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6778  protein of unknown function DUF1452  48.25 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4800  hypothetical protein  41.96 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.060799 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2012  hypothetical protein  49.12 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6797  hypothetical protein  42.14 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1464  protein of unknown function DUF1452  46.72 
 
 		 135 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136392  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0074  hypothetical protein  44.72 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.809247  hitchhiker  0.00118298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3464  protein of unknown function DUF1452  60.67 
 
 		 140 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0079  protein of unknown function DUF1452  46.22 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.469341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1925  hypothetical protein  50.39 
 
 		 158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2630  hypothetical protein  46.15 
 
 		 124 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  0.332594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0450  hypothetical protein  58.75 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2306  hypothetical protein  57.78 
 
 		 136 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00866785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2859  protein of unknown function DUF1452  46.04 
 
 		 156 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.471643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2766  protein of unknown function DUF1452  47.24 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5070  hypothetical protein  46.21 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1325  hypothetical protein  52.88 
 
 		 136 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2673  hypothetical protein  45.67 
 
 		 135 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2181  hypothetical protein  51.85 
 
 		 85 aa  88.2  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2590  protein of unknown function DUF1452  57.58 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8259  protein of unknown function DUF1452  57.58 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.653302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3036  hypothetical protein  69.77 
 
 		 46 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367965  normal  0.733204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3461  protein of unknown function DUF1452  43.75 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126188  hitchhiker  0.000453581 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5831  protein of unknown function DUF1452  36.47 
 
 		 106 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4842  hypothetical protein  45.83 
 
 		 119 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0133702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>