17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4842 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4842  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  239  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0133702 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5349  hypothetical protein  33.94 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5831  protein of unknown function DUF1452  31.25 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1697  hypothetical protein  35.05 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36360  hypothetical protein  32.1 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190615  normal  0.857259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3113  hypothetical protein  25.95 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6412  protein of unknown function DUF1452  31.73 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1145  hypothetical protein  30.69 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6107  protein of unknown function DUF1452  32.32 
 
 		 146 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4128  hypothetical protein  45.83 
 
 		 181 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.805383  normal  0.0712153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4180  hypothetical protein  31.82 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2040  protein of unknown function DUF1452  38.71 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  hitchhiker  0.00000004255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2673  hypothetical protein  30.88 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0878  hypothetical protein  28.43 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.337584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1999  hypothetical protein  26.09 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0935237  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2766  protein of unknown function DUF1452  30.77 
 
 		 135 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>