53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5831 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5831  protein of unknown function DUF1452  100 
 
 
106 aa  216  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1963  hypothetical protein  31.18 
 
 
183 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1870  hypothetical protein  31.18 
 
 
183 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.346041  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4800  hypothetical protein  29.03 
 
 
175 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.060799 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6543  hypothetical protein  30.19 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.687161  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0402  hypothetical protein  31.18 
 
 
332 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1288  hypothetical protein  30.19 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71134  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6150  hypothetical protein  30.19 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374838  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2040  protein of unknown function DUF1452  28.87 
 
 
172 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  hitchhiker  0.00000004255 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0074  hypothetical protein  29.9 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.809247  hitchhiker  0.00118298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2012  hypothetical protein  28.87 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1416  protein of unknown function DUF1452  36 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534453  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5514  hypothetical protein  29.81 
 
 
170 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4180  hypothetical protein  29.9 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6797  hypothetical protein  30.3 
 
 
170 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5867  hypothetical protein  27.37 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3113  hypothetical protein  26.42 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2666  hypothetical protein  29.81 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.805383  normal  0.0712153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2630  hypothetical protein  24.51 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  0.332594 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4128  hypothetical protein  36.47 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4091  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0878  hypothetical protein  32.29 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.337584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1325  hypothetical protein  31.13 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1887  hypothetical protein  29.41 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.645116  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2131  protein of unknown function DUF1452  28 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1925  hypothetical protein  31.58 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36360  hypothetical protein  30.34 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190615  normal  0.857259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6172  protein of unknown function DUF1452  30.93 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.714343  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0387  protein of unknown function DUF1452  30.53 
 
 
189 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4318  hypothetical protein  34.09 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5070  hypothetical protein  38.6 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1922  protein of unknown function DUF1452  30.48 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.829708  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1145  hypothetical protein  30.95 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6243  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.186882  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1697  hypothetical protein  32.94 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5349  hypothetical protein  28.12 
 
 
168 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1801  hypothetical protein  36.36 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.611763  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0272  hypothetical protein  29.2 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6412  protein of unknown function DUF1452  30 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4842  hypothetical protein  31.25 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0133702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3960  hypothetical protein  38.18 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6107  protein of unknown function DUF1452  28.89 
 
 
146 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3464  protein of unknown function DUF1452  28.95 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0079  protein of unknown function DUF1452  27.27 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.469341  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2994  hypothetical protein  31.03 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1464  protein of unknown function DUF1452  27.68 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136392  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3342  hypothetical protein  38.18 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7034  protein of unknown function DUF1452  34.92 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0988  protein of unknown function DUF1452  25.56 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2306  hypothetical protein  47.37 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00866785  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4384  hypothetical protein  27.96 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1999  hypothetical protein  32.89 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0935237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0450  hypothetical protein  30.43 
 
 
162 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0954224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>