66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4384 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4384  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  309  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6346  hypothetical protein  82.86 
 
 		 140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2131  protein of unknown function DUF1452  62.39 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1922  protein of unknown function DUF1452  59.83 
 
 		 159 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.829708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6107  protein of unknown function DUF1452  56.12 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6412  protein of unknown function DUF1452  60 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1464  protein of unknown function DUF1452  66.09 
 
 		 135 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136392  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1887  hypothetical protein  53.44 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.645116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6243  hypothetical protein  61.74 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.186882  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7034  protein of unknown function DUF1452  64.35 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1265  hypothetical protein  54.81 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0835472  normal  0.0149766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1145  hypothetical protein  51.13 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3960  hypothetical protein  57.84 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4180  hypothetical protein  53.85 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2306  hypothetical protein  68.97 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00866785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3113  hypothetical protein  50.38 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0079  protein of unknown function DUF1452  46.48 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.469341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2040  protein of unknown function DUF1452  56.88 
 
 		 172 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  hitchhiker  0.00000004255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2012  hypothetical protein  55.96 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0074  hypothetical protein  55.05 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.809247  hitchhiker  0.00118298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0988  protein of unknown function DUF1452  44.6 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1697  hypothetical protein  56.36 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1416  protein of unknown function DUF1452  45.26 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534453  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5867  hypothetical protein  46.21 
 
 		 173 aa  124  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0402  hypothetical protein  55.45 
 
 		 332 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6293  protein of unknown function DUF1452  61.54 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4128  hypothetical protein  50.98 
 
 		 181 aa  123  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4801  protein of unknown function DUF1452  62.04 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853628  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6797  hypothetical protein  48.48 
 
 		 170 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1870  hypothetical protein  56.6 
 
 		 183 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.346041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1963  hypothetical protein  56.6 
 
 		 183 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801757  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5514  hypothetical protein  53.45 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1801  hypothetical protein  55.24 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.611763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1288  hypothetical protein  50.41 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0387  protein of unknown function DUF1452  41.72 
 
 		 189 aa  121  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6150  hypothetical protein  50.41 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374838  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2994  hypothetical protein  52.43 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6543  hypothetical protein  50.41 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.687161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2666  hypothetical protein  54.46 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.805383  normal  0.0712153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4800  hypothetical protein  49.12 
 
 		 175 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.060799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3342  hypothetical protein  57.02 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4318  hypothetical protein  47.58 
 
 		 163 aa  118  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4091  hypothetical protein  50.83 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2630  hypothetical protein  50.86 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  0.332594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36360  hypothetical protein  63.75 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190615  normal  0.857259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0450  hypothetical protein  63.29 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5070  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1925  hypothetical protein  67.09 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235756  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6172  protein of unknown function DUF1452  64.56 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.714343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5349  hypothetical protein  42.11 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4617  hypothetical protein  62.04 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0878  hypothetical protein  55.17 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.337584 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6778  protein of unknown function DUF1452  40.29 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0272  hypothetical protein  56.96 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1999  hypothetical protein  43.22 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0935237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1325  hypothetical protein  47.9 
 
 		 136 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3464  protein of unknown function DUF1452  50 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2859  protein of unknown function DUF1452  49.55 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.471643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2766  protein of unknown function DUF1452  49.55 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8259  protein of unknown function DUF1452  55.88 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.653302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2673  hypothetical protein  48.65 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2181  hypothetical protein  69.23 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2590  protein of unknown function DUF1452  53.62 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3461  protein of unknown function DUF1452  39.37 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126188  hitchhiker  0.000453581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3036  hypothetical protein  58.14 
 
 		 46 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367965  normal  0.733204 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5831  protein of unknown function DUF1452  27.96 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>