66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4801 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4801  protein of unknown function DUF1452  100 
 
 
143 aa  287  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6107  protein of unknown function DUF1452  72.03 
 
 
146 aa  204  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6412  protein of unknown function DUF1452  73.08 
 
 
152 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4617  hypothetical protein  91.96 
 
 
166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1887  hypothetical protein  68.46 
 
 
149 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.645116  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6243  hypothetical protein  75.45 
 
 
153 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.186882  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3960  hypothetical protein  60.14 
 
 
159 aa  176  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4128  hypothetical protein  59.26 
 
 
181 aa  176  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1145  hypothetical protein  62.18 
 
 
162 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3342  hypothetical protein  57.46 
 
 
154 aa  150  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4180  hypothetical protein  62.61 
 
 
143 aa  149  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4384  hypothetical protein  52.45 
 
 
151 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6346  hypothetical protein  56.9 
 
 
140 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1265  hypothetical protein  59.65 
 
 
162 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0835472  normal  0.0149766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6293  protein of unknown function DUF1452  61.21 
 
 
148 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1922  protein of unknown function DUF1452  50.35 
 
 
159 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.829708  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1697  hypothetical protein  55.38 
 
 
136 aa  141  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2131  protein of unknown function DUF1452  54.01 
 
 
155 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7034  protein of unknown function DUF1452  57.46 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1801  hypothetical protein  58.12 
 
 
136 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.611763  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5349  hypothetical protein  57.02 
 
 
168 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1464  protein of unknown function DUF1452  57.14 
 
 
135 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136392  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4091  hypothetical protein  59.05 
 
 
142 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2994  hypothetical protein  50.74 
 
 
148 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2666  hypothetical protein  52.85 
 
 
131 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.805383  normal  0.0712153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6172  protein of unknown function DUF1452  64.37 
 
 
153 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.714343  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4800  hypothetical protein  52.85 
 
 
175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.060799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0988  protein of unknown function DUF1452  47.06 
 
 
160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2040  protein of unknown function DUF1452  52.76 
 
 
172 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  hitchhiker  0.00000004255 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6150  hypothetical protein  52.24 
 
 
168 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374838  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5867  hypothetical protein  48.48 
 
 
173 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3113  hypothetical protein  45.99 
 
 
141 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5514  hypothetical protein  58.1 
 
 
170 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0074  hypothetical protein  57.01 
 
 
169 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.809247  hitchhiker  0.00118298 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6543  hypothetical protein  51.49 
 
 
168 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.687161  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1288  hypothetical protein  51.49 
 
 
168 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71134  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4318  hypothetical protein  55.34 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6797  hypothetical protein  51.61 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2012  hypothetical protein  57.01 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0079  protein of unknown function DUF1452  48.39 
 
 
160 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.469341  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0878  hypothetical protein  62.96 
 
 
136 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.337584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1416  protein of unknown function DUF1452  49.26 
 
 
168 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534453  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2306  hypothetical protein  60 
 
 
136 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00866785  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2630  hypothetical protein  48.33 
 
 
124 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  0.332594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1925  hypothetical protein  56.56 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235756  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0387  protein of unknown function DUF1452  54.37 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0402  hypothetical protein  51.33 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1963  hypothetical protein  51.33 
 
 
183 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1870  hypothetical protein  51.33 
 
 
183 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.346041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36360  hypothetical protein  60.24 
 
 
140 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190615  normal  0.857259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0450  hypothetical protein  60.71 
 
 
162 aa  115  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0272  hypothetical protein  56.41 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1999  hypothetical protein  48.21 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0935237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3464  protein of unknown function DUF1452  61.63 
 
 
140 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6778  protein of unknown function DUF1452  42.52 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1325  hypothetical protein  57.14 
 
 
136 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5070  hypothetical protein  54.29 
 
 
199 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2859  protein of unknown function DUF1452  46.83 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.471643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2766  protein of unknown function DUF1452  46.83 
 
 
135 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2673  hypothetical protein  46.83 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2181  hypothetical protein  64.81 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2590  protein of unknown function DUF1452  56.06 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8259  protein of unknown function DUF1452  56.06 
 
 
111 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.653302  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3461  protein of unknown function DUF1452  45.92 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126188  hitchhiker  0.000453581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3036  hypothetical protein  74.42 
 
 
46 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367965  normal  0.733204 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5831  protein of unknown function DUF1452  31.52 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>