66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3464 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3464  protein of unknown function DUF1452  100 
 
 
140 aa  285  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4180  hypothetical protein  54.89 
 
 
143 aa  149  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4091  hypothetical protein  67.65 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1145  hypothetical protein  57.26 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4128  hypothetical protein  55.37 
 
 
181 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0988  protein of unknown function DUF1452  47.73 
 
 
160 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1801  hypothetical protein  50.88 
 
 
136 aa  134  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.611763  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3113  hypothetical protein  49.59 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3960  hypothetical protein  55.36 
 
 
159 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2630  hypothetical protein  52.14 
 
 
124 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  0.332594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0387  protein of unknown function DUF1452  51.72 
 
 
189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5867  hypothetical protein  44.36 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6243  hypothetical protein  57.14 
 
 
153 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.186882  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6172  protein of unknown function DUF1452  61.02 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.714343  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1416  protein of unknown function DUF1452  53.45 
 
 
168 aa  126  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534453  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4318  hypothetical protein  47.24 
 
 
163 aa  126  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0272  hypothetical protein  58.06 
 
 
142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6412  protein of unknown function DUF1452  52.99 
 
 
152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2666  hypothetical protein  53.64 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.805383  normal  0.0712153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6107  protein of unknown function DUF1452  54.55 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1887  hypothetical protein  54.24 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.645116  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0450  hypothetical protein  58.73 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0079  protein of unknown function DUF1452  47.33 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.469341  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2306  hypothetical protein  59.52 
 
 
136 aa  124  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00866785  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36360  hypothetical protein  54.31 
 
 
140 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190615  normal  0.857259 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6346  hypothetical protein  43.17 
 
 
140 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2994  hypothetical protein  51.35 
 
 
148 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5514  hypothetical protein  45.59 
 
 
170 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1265  hypothetical protein  51.85 
 
 
162 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0835472  normal  0.0149766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0878  hypothetical protein  55.86 
 
 
136 aa  120  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.337584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1697  hypothetical protein  50.42 
 
 
136 aa  120  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1925  hypothetical protein  58.77 
 
 
158 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235756  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6150  hypothetical protein  49.14 
 
 
168 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374838  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6778  protein of unknown function DUF1452  46.92 
 
 
155 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3342  hypothetical protein  54.87 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2040  protein of unknown function DUF1452  47.06 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  hitchhiker  0.00000004255 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5349  hypothetical protein  43.59 
 
 
168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1325  hypothetical protein  54.95 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6543  hypothetical protein  47.41 
 
 
168 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.687161  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1288  hypothetical protein  47.41 
 
 
168 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71134  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4384  hypothetical protein  48.62 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6797  hypothetical protein  46.9 
 
 
170 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4800  hypothetical protein  46.09 
 
 
175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.060799 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2012  hypothetical protein  45.22 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6293  protein of unknown function DUF1452  50 
 
 
148 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0074  hypothetical protein  48.04 
 
 
169 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.809247  hitchhiker  0.00118298 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0402  hypothetical protein  47.75 
 
 
332 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5070  hypothetical protein  52.25 
 
 
199 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1922  protein of unknown function DUF1452  44.09 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.829708  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1464  protein of unknown function DUF1452  53.33 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136392  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1870  hypothetical protein  47.37 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.346041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1963  hypothetical protein  47.37 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2131  protein of unknown function DUF1452  45.38 
 
 
155 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1999  hypothetical protein  42.74 
 
 
124 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0935237  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7034  protein of unknown function DUF1452  52.88 
 
 
132 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4617  hypothetical protein  57.66 
 
 
166 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4801  protein of unknown function DUF1452  57.28 
 
 
143 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2859  protein of unknown function DUF1452  47.83 
 
 
156 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.471643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2673  hypothetical protein  49.56 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2766  protein of unknown function DUF1452  48.67 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8259  protein of unknown function DUF1452  58.21 
 
 
111 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.653302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2181  hypothetical protein  51.22 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2590  protein of unknown function DUF1452  56.72 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3461  protein of unknown function DUF1452  41.24 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126188  hitchhiker  0.000453581 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5831  protein of unknown function DUF1452  34.38 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3036  hypothetical protein  65.12 
 
 
46 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367965  normal  0.733204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>