66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4617 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4617  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  330  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6107  protein of unknown function DUF1452  73.72 
 
 
146 aa  201  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6412  protein of unknown function DUF1452  73.08 
 
 
152 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4801  protein of unknown function DUF1452  92.59 
 
 
143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853628  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1887  hypothetical protein  69.7 
 
 
149 aa  186  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.645116  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6243  hypothetical protein  75 
 
 
153 aa  180  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.186882  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1145  hypothetical protein  61.9 
 
 
162 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4128  hypothetical protein  57.35 
 
 
181 aa  174  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3960  hypothetical protein  59.12 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4180  hypothetical protein  63.48 
 
 
143 aa  152  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3342  hypothetical protein  59.68 
 
 
154 aa  151  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6293  protein of unknown function DUF1452  62.93 
 
 
148 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1265  hypothetical protein  61.4 
 
 
162 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0835472  normal  0.0149766 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4384  hypothetical protein  62.04 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1922  protein of unknown function DUF1452  51.06 
 
 
159 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.829708  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6346  hypothetical protein  58.33 
 
 
140 aa  141  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2131  protein of unknown function DUF1452  53.28 
 
 
155 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1697  hypothetical protein  62.04 
 
 
136 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7034  protein of unknown function DUF1452  57.78 
 
 
132 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2666  hypothetical protein  52.85 
 
 
131 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.805383  normal  0.0712153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1464  protein of unknown function DUF1452  57.94 
 
 
135 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136392  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1801  hypothetical protein  56.8 
 
 
136 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.611763  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4091  hypothetical protein  58.1 
 
 
142 aa  134  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5349  hypothetical protein  57.27 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5514  hypothetical protein  58.1 
 
 
170 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4800  hypothetical protein  49.65 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.060799 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6150  hypothetical protein  52.24 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374838  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0988  protein of unknown function DUF1452  56.73 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2994  hypothetical protein  49.26 
 
 
148 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6543  hypothetical protein  51.49 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.687161  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1288  hypothetical protein  51.49 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71134  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2306  hypothetical protein  62.61 
 
 
136 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00866785  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6797  hypothetical protein  57.84 
 
 
170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6172  protein of unknown function DUF1452  56.41 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.714343  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0074  hypothetical protein  52.46 
 
 
169 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.809247  hitchhiker  0.00118298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3113  hypothetical protein  53.27 
 
 
141 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0079  protein of unknown function DUF1452  47.76 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.469341  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2040  protein of unknown function DUF1452  56.07 
 
 
172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  hitchhiker  0.00000004255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0878  hypothetical protein  62.04 
 
 
136 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.337584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1416  protein of unknown function DUF1452  59.62 
 
 
168 aa  124  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534453  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2012  hypothetical protein  56.07 
 
 
158 aa  123  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5867  hypothetical protein  45.86 
 
 
173 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4318  hypothetical protein  46.56 
 
 
163 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2630  hypothetical protein  47.9 
 
 
124 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  0.332594 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0402  hypothetical protein  55.24 
 
 
332 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0450  hypothetical protein  59.78 
 
 
162 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0387  protein of unknown function DUF1452  44.9 
 
 
189 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1870  hypothetical protein  55.24 
 
 
183 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.346041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1963  hypothetical protein  55.24 
 
 
183 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36360  hypothetical protein  48.44 
 
 
140 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190615  normal  0.857259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1925  hypothetical protein  52.8 
 
 
158 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0272  hypothetical protein  54.7 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1999  hypothetical protein  45.76 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0935237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3464  protein of unknown function DUF1452  60.87 
 
 
140 aa  114  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6778  protein of unknown function DUF1452  46.15 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5070  hypothetical protein  53.33 
 
 
199 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1325  hypothetical protein  50.88 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2859  protein of unknown function DUF1452  44.62 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.471643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2766  protein of unknown function DUF1452  44.62 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2673  hypothetical protein  44.7 
 
 
135 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2590  protein of unknown function DUF1452  57.58 
 
 
111 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8259  protein of unknown function DUF1452  57.58 
 
 
111 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.653302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2181  hypothetical protein  64.81 
 
 
85 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3461  protein of unknown function DUF1452  42.86 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126188  hitchhiker  0.000453581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3036  hypothetical protein  74.42 
 
 
46 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367965  normal  0.733204 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5831  protein of unknown function DUF1452  30.63 
 
 
106 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>