66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3960 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3960  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  319  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4128  hypothetical protein  67.86 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3342  hypothetical protein  70.39 
 
 		 154 aa  204  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1145  hypothetical protein  66.91 
 
 		 162 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6107  protein of unknown function DUF1452  61.15 
 
 		 146 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6412  protein of unknown function DUF1452  62.7 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6243  hypothetical protein  66.98 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.186882  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1887  hypothetical protein  63.79 
 
 		 149 aa  157  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.645116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4180  hypothetical protein  55.4 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1697  hypothetical protein  64.55 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6293  protein of unknown function DUF1452  52.94 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6346  hypothetical protein  59.8 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.443955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1265  hypothetical protein  49.63 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0835472  normal  0.0149766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1801  hypothetical protein  54.7 
 
 		 136 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.611763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4091  hypothetical protein  56.14 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4384  hypothetical protein  57.84 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4801  protein of unknown function DUF1452  65.71 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2306  hypothetical protein  56.8 
 
 		 136 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00866785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4617  hypothetical protein  63.89 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0387  protein of unknown function DUF1452  54.55 
 
 		 189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5349  hypothetical protein  46.62 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3113  hypothetical protein  49.59 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1922  protein of unknown function DUF1452  50.81 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.829708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2040  protein of unknown function DUF1452  45.39 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  hitchhiker  0.00000004255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4318  hypothetical protein  49.59 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6172  protein of unknown function DUF1452  64.84 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.714343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6778  protein of unknown function DUF1452  49.18 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2131  protein of unknown function DUF1452  52.94 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0988  protein of unknown function DUF1452  46.76 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2666  hypothetical protein  51.64 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.805383  normal  0.0712153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1416  protein of unknown function DUF1452  50.86 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534453  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0272  hypothetical protein  64.77 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0878  hypothetical protein  59.26 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.337584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2012  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2994  hypothetical protein  44.8 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36360  hypothetical protein  52.63 
 
 		 140 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190615  normal  0.857259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0079  protein of unknown function DUF1452  46.03 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.469341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1464  protein of unknown function DUF1452  49.19 
 
 		 135 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136392  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0450  hypothetical protein  63.75 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0074  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.809247  hitchhiker  0.00118298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4800  hypothetical protein  42.04 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.060799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2630  hypothetical protein  49.55 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.98341  normal  0.332594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5867  hypothetical protein  45.08 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6150  hypothetical protein  49.59 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374838  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1288  hypothetical protein  49.59 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71134  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1925  hypothetical protein  55.93 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235756  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7034  protein of unknown function DUF1452  50.43 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6543  hypothetical protein  49.59 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.687161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6797  hypothetical protein  40.13 
 
 		 170 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3464  protein of unknown function DUF1452  60.23 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1999  hypothetical protein  45.61 
 
 		 124 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0935237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0402  hypothetical protein  52.43 
 
 		 332 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5514  hypothetical protein  47.58 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1870  hypothetical protein  52.43 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.346041  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1963  hypothetical protein  52.43 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2673  hypothetical protein  52.42 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2859  protein of unknown function DUF1452  51.61 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.471643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2766  protein of unknown function DUF1452  51.61 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0851587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5070  hypothetical protein  61.84 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1325  hypothetical protein  47.37 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2181  hypothetical protein  54.88 
 
 		 85 aa  87  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8259  protein of unknown function DUF1452  59.09 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.653302  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2590  protein of unknown function DUF1452  57.58 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3461  protein of unknown function DUF1452  46.15 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126188  hitchhiker  0.000453581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3036  hypothetical protein  62.79 
 
 		 46 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367965  normal  0.733204 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5831  protein of unknown function DUF1452  38.18 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>