121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5110 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5110  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122941  normal  0.136795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  85.14 
 
 		 504 aa  300  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  85.14 
 
 		 504 aa  300  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  85.06 
 
 		 501 aa  297  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  85.06 
 
 		 501 aa  297  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  85.06 
 
 		 501 aa  297  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  85.06 
 
 		 501 aa  297  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  85.06 
 
 		 501 aa  297  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  85.06 
 
 		 501 aa  297  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  85.06 
 
 		 501 aa  297  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  73.14 
 
 		 502 aa  263  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  73.14 
 
 		 502 aa  263  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  73.14 
 
 		 502 aa  263  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  57.14 
 
 		 501 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  57.14 
 
 		 501 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  53.98 
 
 		 356 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 		 499 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 		 499 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 		 499 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  53.98 
 
 		 499 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  53.98 
 
 		 499 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  56 
 
 		 501 aa  188  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  55.43 
 
 		 496 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 		 499 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 		 499 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  55.11 
 
 		 499 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  53.67 
 
 		 499 aa  180  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  55.11 
 
 		 502 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  84.38 
 
 		 423 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 504 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 504 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 504 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 504 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 504 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 504 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 504 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 504 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 504 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  44.51 
 
 		 503 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  45.71 
 
 		 506 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  40.33 
 
 		 503 aa  144  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  40.33 
 
 		 503 aa  144  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  40.33 
 
 		 503 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  43.18 
 
 		 373 aa  144  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  41.71 
 
 		 497 aa  131  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  42.26 
 
 		 496 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  42.26 
 
 		 496 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  42.26 
 
 		 496 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4985  hypothetical protein  74.07 
 
 		 98 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  40 
 
 		 508 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  35.43 
 
 		 502 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  39.38 
 
 		 508 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 488 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 507 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 507 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 507 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  38.64 
 
 		 507 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 		 508 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  39.53 
 
 		 503 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4455  putative transposase  39.53 
 
 		 503 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2113  Integrase catalytic region  35.23 
 
 		 503 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  38.12 
 
 		 508 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  38.12 
 
 		 508 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  38.51 
 
 		 505 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  38.51 
 
 		 505 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  38.51 
 
 		 505 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  38.51 
 
 		 505 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 501 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 501 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 501 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 501 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 501 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 501 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  38.15 
 
 		 501 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  33.9 
 
 		 501 aa  98.6  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 		 504 aa  98.2  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 		 510 aa  97.8  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 		 510 aa  97.8  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 		 510 aa  97.8  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 		 510 aa  97.8  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  32.79 
 
 		 507 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  35.63 
 
 		 509 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  35.63 
 
 		 509 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  33.14 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  33.14 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  33.14 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  31.18 
 
 		 494 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  31.18 
 
 		 494 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  31.18 
 
 		 494 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  31.18 
 
 		 494 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  28.85 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  35.87 
 
 		 499 aa  72.8  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  35.87 
 
 		 499 aa  72.8  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  35.87 
 
 		 499 aa  72.8  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  32.35 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  30.59 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  30.59 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  29.55 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  32.2 
 
 		 502 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  31.64 
 
 		 497 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>