45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4985 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4985  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  93.33 
 
 		 501 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  93.33 
 
 		 501 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  93.33 
 
 		 501 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  93.33 
 
 		 501 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  93.33 
 
 		 501 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  93.33 
 
 		 501 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  93.33 
 
 		 501 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  80 
 
 		 504 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  80 
 
 		 504 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5110  hypothetical protein  74.07 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122941  normal  0.136795 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  70.67 
 
 		 502 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  70.67 
 
 		 502 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  70.67 
 
 		 502 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  51.32 
 
 		 499 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  47.37 
 
 		 356 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 496 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  48.68 
 
 		 501 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  48.68 
 
 		 501 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  46.05 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 		 499 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 		 499 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 		 499 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  46.05 
 
 		 499 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  46.05 
 
 		 499 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 		 499 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 		 499 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  39.33 
 
 		 501 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  40 
 
 		 502 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  44.29 
 
 		 373 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  35.56 
 
 		 497 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  34.88 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  35.8 
 
 		 503 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  30.86 
 
 		 503 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  30.86 
 
 		 503 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  30.86 
 
 		 503 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  34.78 
 
 		 506 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>