More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4813 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4813  sugar transferase  100 
 
 
428 aa  864    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1711  sugar transferase  38.2 
 
 
475 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0671  sugar transferase  35.7 
 
 
415 aa  239  5e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3245  sugar transferase  34.53 
 
 
437 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  44.44 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2598  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.27 
 
 
437 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2718  sugar transferase  34.79 
 
 
441 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0813786  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0743  sugar transferase  42.51 
 
 
437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1535  sugar transferase  40.08 
 
 
469 aa  186  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  42.74 
 
 
458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.77 
 
 
465 aa  183  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2496  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  43.41 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.92 
 
 
463 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  37.97 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  39.92 
 
 
469 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  38.46 
 
 
461 aa  180  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  40 
 
 
454 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  40.5 
 
 
548 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.9 
 
 
460 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.78 
 
 
469 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  40.16 
 
 
483 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  45.64 
 
 
464 aa  176  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.44 
 
 
465 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  40.5 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3439  sugar transferase  40.83 
 
 
462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248565  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.85 
 
 
484 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  38.02 
 
 
402 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.67 
 
 
346 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  39.92 
 
 
453 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  41.18 
 
 
358 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  37.7 
 
 
460 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  48.39 
 
 
498 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1030  sugar transferase  42.99 
 
 
494 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  44.14 
 
 
494 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0948  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.33 
 
 
462 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0841997  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.7 
 
 
464 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  35.57 
 
 
459 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  41.18 
 
 
329 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.24 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3300  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.45 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609439  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  48.94 
 
 
501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4149  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  47.45 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4217  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  47.45 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2476  sugar transferase  40.57 
 
 
366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0247717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.28 
 
 
231 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  47.03 
 
 
484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.06 
 
 
426 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  46.43 
 
 
471 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2459  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.85 
 
 
498 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721842  normal  0.253971 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  34.63 
 
 
432 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0519  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  41.13 
 
 
311 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3064  sugar transferase  44.1 
 
 
490 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0107  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.18 
 
 
449 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.35 
 
 
475 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0974  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.57 
 
 
499 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  44.04 
 
 
477 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1171  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.57 
 
 
501 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1044  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.57 
 
 
501 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.0474242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  43.09 
 
 
466 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.92 
 
 
468 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0583  sugar transferase  44.33 
 
 
470 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2747  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.65 
 
 
459 aa  159  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0373385  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.78 
 
 
477 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2413  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.77 
 
 
427 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000393104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  40.34 
 
 
443 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  40.96 
 
 
464 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.96 
 
 
464 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.96 
 
 
464 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.96 
 
 
464 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.96 
 
 
464 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  44.79 
 
 
461 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.02 
 
 
464 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.96 
 
 
464 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  40.96 
 
 
464 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.96 
 
 
464 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3938  sugar transferase  43.3 
 
 
245 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.25 
 
 
472 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  41.67 
 
 
459 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  44.62 
 
 
472 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  41.18 
 
 
464 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2049  sugar transferase  40.67 
 
 
467 aa  156  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3136  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.34 
 
 
306 aa  156  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.065759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3560  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.3 
 
 
468 aa  156  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0295  sugar transferase  42.79 
 
 
214 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.199839  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.1 
 
 
459 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.03 
 
 
460 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  43.68 
 
 
460 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  43.68 
 
 
460 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43.68 
 
 
460 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  43.68 
 
 
460 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  41.03 
 
 
460 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3829  sugar transferase  40.54 
 
 
464 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0295  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34 
 
 
408 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43.68 
 
 
461 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43.68 
 
 
460 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.03 
 
 
460 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  43 
 
 
242 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1068  putative glycosyl transferase  43.32 
 
 
494 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  43.68 
 
 
460 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  41.24 
 
 
460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>