More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0671 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0671  sugar transferase  100 
 
 
415 aa  851    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1711  sugar transferase  39.64 
 
 
475 aa  276  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4813  sugar transferase  36.08 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3245  sugar transferase  43.36 
 
 
437 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2598  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.58 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  40.39 
 
 
436 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0743  sugar transferase  39.21 
 
 
437 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  43.89 
 
 
461 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2718  sugar transferase  41.06 
 
 
441 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0813786  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  38.19 
 
 
469 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1535  sugar transferase  47.12 
 
 
469 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.47 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1171  sugar transferase  42.19 
 
 
470 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2496  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  46.88 
 
 
464 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  39.76 
 
 
448 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  39.69 
 
 
358 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.43 
 
 
426 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  36.77 
 
 
329 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.7 
 
 
463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  35.6 
 
 
494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  39.75 
 
 
460 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1030  sugar transferase  50 
 
 
494 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2747  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.89 
 
 
459 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0373385  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0948  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.21 
 
 
462 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0841997  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0583  sugar transferase  48.84 
 
 
470 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  39.66 
 
 
483 aa  170  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  36.92 
 
 
464 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.55 
 
 
465 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  37.25 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25451  sugar transferase  46.84 
 
 
443 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0107  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.05 
 
 
449 aa  166  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0131  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  46.99 
 
 
469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  43.85 
 
 
459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3439  sugar transferase  40.17 
 
 
462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248565  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  35.56 
 
 
548 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02598  sugar transferase domain protein  41.35 
 
 
470 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  43.85 
 
 
459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.23 
 
 
460 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  40.62 
 
 
454 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5023  sugar transferase domain-containing protein  38.06 
 
 
467 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  33.33 
 
 
432 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.23 
 
 
484 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0929  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.84 
 
 
426 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.509222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1281  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.11 
 
 
426 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12388  sugar transferase  36.71 
 
 
464 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3794  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  49.08 
 
 
473 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.37 
 
 
469 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2189  sugar transferase  40 
 
 
452 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.95 
 
 
465 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2614  sugar transferase  43.86 
 
 
465 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560673  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  35.08 
 
 
464 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  41.58 
 
 
242 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1661  sugar transferase  47.69 
 
 
470 aa  156  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.91 
 
 
477 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  42.78 
 
 
458 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2647  sugar transferase  40.53 
 
 
463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00209327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2413  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.11 
 
 
427 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000393104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.94 
 
 
231 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2476  sugar transferase  44.31 
 
 
366 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0247717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2733  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.53 
 
 
463 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0314913  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1735  sugar transferase  41.62 
 
 
306 aa  152  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0115  sugar transferase  45.64 
 
 
194 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  43.81 
 
 
230 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  43.11 
 
 
443 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  32.27 
 
 
453 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0295  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.49 
 
 
408 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2828  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.53 
 
 
302 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  42.93 
 
 
447 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.62 
 
 
470 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.32 
 
 
475 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0296  sugar transferase  42.02 
 
 
408 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0402  sugar transferase  35.04 
 
 
310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2049  sugar transferase  38.5 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.08 
 
 
476 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43 
 
 
212 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43 
 
 
212 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43 
 
 
212 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.81 
 
 
471 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.65 
 
 
467 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.62 
 
 
450 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.68 
 
 
212 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  40.84 
 
 
471 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5394  glucosyltransferase EpsB  41.71 
 
 
219 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.059806  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.79 
 
 
471 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_002950  PG1964  sugar transferase  39.63 
 
 
468 aa  143  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.93 
 
 
464 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  41.27 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  40.45 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  39.69 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  42.39 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.39 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.39 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.39 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.39 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.41 
 
 
461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.39 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  42.39 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3176  sugar transferase  41.85 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624901  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0519  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  38.74 
 
 
311 aa  141  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1539  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.85 
 
 
506 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>