More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0199 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  100 
 
 
464 aa  935    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  49.57 
 
 
463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  50 
 
 
461 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.97 
 
 
465 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2496  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  48.64 
 
 
464 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1535  sugar transferase  48.52 
 
 
469 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0583  sugar transferase  46.9 
 
 
470 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  46.92 
 
 
484 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.18 
 
 
465 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  49.03 
 
 
460 aa  361  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  53.07 
 
 
460 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  44.31 
 
 
469 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  40.66 
 
 
483 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0948  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.07 
 
 
462 aa  335  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0841997  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0131  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.67 
 
 
469 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2049  sugar transferase  43.28 
 
 
467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3439  sugar transferase  42.8 
 
 
462 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248565  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  39.78 
 
 
459 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1661  sugar transferase  39.45 
 
 
470 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  41.75 
 
 
454 aa  308  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1171  sugar transferase  41.53 
 
 
470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  39.14 
 
 
459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  42.53 
 
 
402 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  41.2 
 
 
453 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02598  sugar transferase domain protein  39.66 
 
 
470 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256018  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  45.51 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5023  sugar transferase domain-containing protein  36.92 
 
 
467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  44 
 
 
548 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2476  sugar transferase  45.82 
 
 
366 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0247717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  42.69 
 
 
458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  40.51 
 
 
448 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  43.5 
 
 
443 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0107  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  54.69 
 
 
449 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  40.95 
 
 
469 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.81 
 
 
426 aa  247  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2733  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.59 
 
 
463 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.86 
 
 
346 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  50 
 
 
358 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1030  sugar transferase  36.62 
 
 
494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  50.83 
 
 
329 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2647  sugar transferase  41.6 
 
 
463 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00209327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3794  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.21 
 
 
473 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2614  sugar transferase  37.66 
 
 
465 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560673  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  41.19 
 
 
494 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2828  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  49.42 
 
 
302 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12388  sugar transferase  32.36 
 
 
464 aa  219  8.999999999999998e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2413  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.39 
 
 
427 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000393104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  53.77 
 
 
242 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.8 
 
 
477 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  31.67 
 
 
448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  43.7 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4588  sugar transferase  40.36 
 
 
333 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501056  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  51.6 
 
 
329 aa  196  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0519  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  43.09 
 
 
311 aa  192  8e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  30.7 
 
 
432 aa  189  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  30.09 
 
 
464 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2747  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.5 
 
 
459 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0373385  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  47.03 
 
 
231 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0743  sugar transferase  34.85 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.26 
 
 
459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.28 
 
 
463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3245  sugar transferase  48.7 
 
 
437 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  45.23 
 
 
212 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  45.23 
 
 
212 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  45.23 
 
 
212 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  45.69 
 
 
212 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  50.81 
 
 
450 aa  182  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2718  sugar transferase  41.5 
 
 
441 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0813786  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.08 
 
 
475 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.24 
 
 
470 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2189  sugar transferase  30.36 
 
 
452 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.11 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.78 
 
 
476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0669  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.92 
 
 
448 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000381309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3089  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.96 
 
 
518 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5394  glucosyltransferase EpsB  45.26 
 
 
219 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.059806  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1964  sugar transferase  48.84 
 
 
468 aa  177  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  31.86 
 
 
466 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1979  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  48.04 
 
 
457 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2598  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.15 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0115  sugar transferase  46.84 
 
 
194 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02218  hypothetical protein  47.24 
 
 
225 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.51 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2726  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  48.65 
 
 
451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  46.84 
 
 
230 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0295  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.39 
 
 
408 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1796  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  31.03 
 
 
478 aa  173  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.56 
 
 
471 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  33.24 
 
 
477 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2459  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  48.62 
 
 
498 aa  171  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721842  normal  0.253971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  48.07 
 
 
498 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0402  sugar transferase  38.49 
 
 
310 aa  170  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0418  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.22 
 
 
495 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1711  sugar transferase  41.25 
 
 
475 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003543  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  47.74 
 
 
212 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0296  sugar transferase  46.07 
 
 
408 aa  166  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1412  sugar transferase  30.62 
 
 
510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.16 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0013  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.91 
 
 
466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.256638  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2682  sugar transferase  35.16 
 
 
514 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>