More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12388 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12388  sugar transferase  100 
 
 
464 aa  939    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  52.59 
 
 
464 aa  518  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1030  sugar transferase  33.2 
 
 
494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  32.92 
 
 
494 aa  269  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  36.27 
 
 
454 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  33.26 
 
 
483 aa  239  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  35.08 
 
 
459 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  35.93 
 
 
453 aa  232  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
402 aa  229  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  32.46 
 
 
460 aa  229  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.55 
 
 
469 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  35.29 
 
 
459 aa  227  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  44.73 
 
 
426 aa  226  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  37.54 
 
 
548 aa  225  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  31.15 
 
 
465 aa  222  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  36.83 
 
 
458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  32.36 
 
 
464 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2496  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  31.49 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  35.26 
 
 
461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0948  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  32.45 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0841997  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  33.05 
 
 
448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  36.65 
 
 
447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.71 
 
 
460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  37.5 
 
 
443 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.78 
 
 
484 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1661  sugar transferase  34.03 
 
 
470 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1535  sugar transferase  33.33 
 
 
469 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  30.04 
 
 
463 aa  205  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2647  sugar transferase  35.1 
 
 
463 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00209327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3794  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.27 
 
 
473 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5023  sugar transferase domain-containing protein  33.18 
 
 
467 aa  203  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1171  sugar transferase  32.42 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0131  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33.78 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02598  sugar transferase domain protein  34.19 
 
 
470 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2476  sugar transferase  37.31 
 
 
366 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0247717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  33.93 
 
 
469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.99 
 
 
465 aa  199  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3439  sugar transferase  32.25 
 
 
462 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248565  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0107  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  30.79 
 
 
449 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2189  sugar transferase  30.56 
 
 
452 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2049  sugar transferase  33.94 
 
 
467 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0583  sugar transferase  30.43 
 
 
470 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2733  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.63 
 
 
463 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  50.56 
 
 
346 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  51.12 
 
 
358 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2828  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.27 
 
 
302 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  49.44 
 
 
329 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2747  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.15 
 
 
459 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0373385  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2614  sugar transferase  34.15 
 
 
465 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560673  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1796  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.31 
 
 
478 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5394  glucosyltransferase EpsB  47.12 
 
 
219 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.059806  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  28.04 
 
 
477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  29.35 
 
 
457 aa  179  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0519  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  49.68 
 
 
311 aa  179  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  28.57 
 
 
467 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  45 
 
 
242 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  30.21 
 
 
476 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0402  sugar transferase  36.17 
 
 
310 aa  175  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  31.52 
 
 
475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.73 
 
 
231 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  44.39 
 
 
212 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  44.39 
 
 
212 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  44.39 
 
 
212 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25451  sugar transferase  40.71 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.39 
 
 
212 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2413  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  32.9 
 
 
427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000393104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4588  sugar transferase  50.64 
 
 
333 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501056  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0743  sugar transferase  39.55 
 
 
437 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  44.33 
 
 
436 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  29.98 
 
 
470 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  30.24 
 
 
473 aa  169  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  30.68 
 
 
463 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02218  hypothetical protein  46.23 
 
 
225 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.66 
 
 
477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.55 
 
 
459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2718  sugar transferase  33.7 
 
 
441 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0813786  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  39.47 
 
 
466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  28.34 
 
 
432 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  32.46 
 
 
471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3697  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  45.45 
 
 
212 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3245  sugar transferase  39 
 
 
437 aa  163  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1648  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  45.45 
 
 
212 aa  163  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.68 
 
 
450 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003543  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  44.22 
 
 
212 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4994  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  28.02 
 
 
470 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13272  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1964  sugar transferase  46.41 
 
 
468 aa  159  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  46.99 
 
 
329 aa  159  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.15 
 
 
448 aa  159  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0295  sugar transferase  45 
 
 
214 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0669  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  32.59 
 
 
448 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000381309 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0295  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  26.85 
 
 
408 aa  158  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2598  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.5 
 
 
437 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1774  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.48 
 
 
483 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0296  sugar transferase  28.38 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0418  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  30.54 
 
 
495 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  29.53 
 
 
466 aa  154  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1735  sugar transferase  46.45 
 
 
306 aa  153  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0671  sugar transferase  36.96 
 
 
415 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  29.13 
 
 
471 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3176  sugar transferase  30.77 
 
 
456 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624901  normal  0.0464887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>