More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1030 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  80.97 
 
 
494 aa  761    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1030  sugar transferase  100 
 
 
494 aa  983    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12388  sugar transferase  32.78 
 
 
464 aa  282  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  45.12 
 
 
402 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  41.82 
 
 
454 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2496  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  38.87 
 
 
464 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  36.21 
 
 
453 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.48 
 
 
460 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0583  sugar transferase  45.17 
 
 
470 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  32.29 
 
 
464 aa  256  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  37.3 
 
 
483 aa  256  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  47.32 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  44.44 
 
 
461 aa  252  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.13 
 
 
465 aa  249  7e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.34 
 
 
465 aa  247  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.07 
 
 
469 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.42 
 
 
484 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  42.58 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  45.9 
 
 
548 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  45.17 
 
 
458 aa  243  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  37.14 
 
 
464 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1171  sugar transferase  39.84 
 
 
470 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  39.04 
 
 
460 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  42.02 
 
 
459 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0948  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.09 
 
 
462 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0841997  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0131  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.8 
 
 
469 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  40.52 
 
 
448 aa  237  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1535  sugar transferase  38.12 
 
 
469 aa  232  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  42.29 
 
 
469 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1661  sugar transferase  41.91 
 
 
470 aa  231  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  41.77 
 
 
447 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02598  sugar transferase domain protein  38.8 
 
 
470 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2476  sugar transferase  47.33 
 
 
366 aa  227  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0247717  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2049  sugar transferase  42.16 
 
 
467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3439  sugar transferase  42.33 
 
 
462 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248565  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  45 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0107  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.22 
 
 
449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3794  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.93 
 
 
473 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.87 
 
 
426 aa  213  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  45.97 
 
 
358 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.97 
 
 
346 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2413  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.26 
 
 
427 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000393104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5023  sugar transferase domain-containing protein  37.91 
 
 
467 aa  211  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  45.56 
 
 
329 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.02 
 
 
476 aa  209  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.64 
 
 
477 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.37 
 
 
470 aa  206  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2189  sugar transferase  37.85 
 
 
452 aa  206  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  55.32 
 
 
242 aa  203  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.78 
 
 
463 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.8 
 
 
475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1796  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.02 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2718  sugar transferase  47.75 
 
 
441 aa  193  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0813786  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  38.24 
 
 
467 aa  192  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0743  sugar transferase  46.85 
 
 
437 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  32.96 
 
 
471 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2614  sugar transferase  38.96 
 
 
465 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560673  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0519  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  44.95 
 
 
311 aa  190  5.999999999999999e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  51.32 
 
 
231 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1711  sugar transferase  40.7 
 
 
475 aa  187  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.49 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.42 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.77 
 
 
477 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0418  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.18 
 
 
495 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3136  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.78 
 
 
306 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.065759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4994  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  29.5 
 
 
470 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.74 
 
 
472 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  34.54 
 
 
469 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  33.15 
 
 
484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1703  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.57 
 
 
511 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0935267  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3245  sugar transferase  50 
 
 
437 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25451  sugar transferase  53.99 
 
 
443 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.62 
 
 
466 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  48.19 
 
 
501 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1979  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.83 
 
 
457 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  31.32 
 
 
432 aa  177  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.51 
 
 
450 aa  177  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5394  glucosyltransferase EpsB  46.63 
 
 
219 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.059806  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  35.69 
 
 
471 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3010  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.14 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  35.78 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0671  sugar transferase  42.92 
 
 
415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2647  sugar transferase  39.04 
 
 
463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00209327  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  32.32 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.7 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  49.47 
 
 
436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3177  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.57 
 
 
469 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2733  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.62 
 
 
463 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0314913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4588  sugar transferase  44.97 
 
 
333 aa  173  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501056  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  47.72 
 
 
329 aa  173  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3194  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.26 
 
 
467 aa  173  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000149665  hitchhiker  0.000297481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3089  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.9 
 
 
518 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33.52 
 
 
465 aa  172  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.93 
 
 
212 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2828  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  50.75 
 
 
302 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0830  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.97 
 
 
489 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.691353  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.34 
 
 
506 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4288  sugar transferase  34.51 
 
 
477 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.222096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2278  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.63 
 
 
467 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83107  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4607  putative sugar transferase family protein  36.81 
 
 
508 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512572  normal  0.0960232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>