More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3102 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  100 
 
 		 483 aa  978    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  42.73 
 
 		 464 aa  336  5.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0948  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.68 
 
 		 462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0841997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1535  sugar transferase  39.67 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2496  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  38.92 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  40.08 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.47 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2049  sugar transferase  49.11 
 
 		 467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  42.63 
 
 		 459 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1661  sugar transferase  38.07 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  37.89 
 
 		 461 aa  310  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  42.9 
 
 		 459 aa  309  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.02 
 
 		 484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3439  sugar transferase  48.21 
 
 		 462 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248565  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.64 
 
 		 460 aa  302  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.29 
 
 		 465 aa  300  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  44.64 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.38 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5023  sugar transferase domain-containing protein  37.53 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.96 
 
 		 465 aa  289  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1171  sugar transferase  36.5 
 
 		 470 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0131  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.4 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  43.24 
 
 		 454 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  42.03 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02598  sugar transferase domain protein  37.98 
 
 		 470 aa  277  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256018  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  48.58 
 
 		 548 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  43.2 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0583  sugar transferase  37.14 
 
 		 470 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2476  sugar transferase  43.53 
 
 		 366 aa  266  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0247717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  40.92 
 
 		 458 aa  262  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  52.05 
 
 		 448 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  44.84 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0107  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  51.64 
 
 		 449 aa  246  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1030  sugar transferase  37.75 
 
 		 494 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2614  sugar transferase  39.72 
 
 		 465 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12388  sugar transferase  34.76 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.44 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  46.03 
 
 		 358 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  46.03 
 
 		 329 aa  229  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  39.24 
 
 		 494 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.1 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3794  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  51.04 
 
 		 473 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  48.33 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  36.31 
 
 		 464 aa  219  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2413  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  30.62 
 
 		 427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000393104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2647  sugar transferase  39.12 
 
 		 463 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00209327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2733  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.53 
 
 		 463 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0314913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4588  sugar transferase  41.76 
 
 		 333 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  53.4 
 
 		 242 aa  205  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2828  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  44.66 
 
 		 302 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  51.32 
 
 		 477 aa  200  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  36.31 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0669  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.11 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000381309 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0519  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  46.52 
 
 		 311 aa  189  9e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5394  glucosyltransferase EpsB  47.92 
 
 		 219 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.059806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  45.31 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2747  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.84 
 
 		 459 aa  183  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0373385  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2189  sugar transferase  33.14 
 
 		 452 aa  183  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.52 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.59 
 
 		 448 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  47.21 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  51.89 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  33.33 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  44.44 
 
 		 212 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  44.44 
 
 		 212 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  44.44 
 
 		 212 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.96 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25451  sugar transferase  45.66 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.97 
 
 		 212 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.73 
 
 		 231 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2726  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  47.72 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0743  sugar transferase  40.59 
 
 		 437 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.56 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3245  sugar transferase  44.86 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3136  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.98 
 
 		 306 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.065759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.52 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1711  sugar transferase  41.76 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.12 
 
 		 471 aa  173  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.47 
 
 		 476 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.06 
 
 		 470 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  40.51 
 
 		 436 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0765  putative lipopolysaccharide biosynthesis related protein  31.24 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.436958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0402  sugar transferase  42.02 
 
 		 310 aa  171  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1735  sugar transferase  42.27 
 
 		 306 aa  170  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.43 
 
 		 475 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.14 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2598  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  44.86 
 
 		 437 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1796  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  33.65 
 
 		 478 aa  170  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  46.03 
 
 		 230 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0115  sugar transferase  46.03 
 
 		 194 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1964  sugar transferase  45.9 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2271  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.04 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2718  sugar transferase  40.76 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0813786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003543  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  43.75 
 
 		 212 aa  167  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3524  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.78 
 
 		 470 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000171122  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1979  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.81 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02218  hypothetical protein  43.54 
 
 		 225 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1044  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.74 
 
 		 501 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.0474242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1171  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.74 
 
 		 501 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0296  sugar transferase  38.17 
 
 		 408 aa  163  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>