More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2189 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2189  sugar transferase  100 
 
 
452 aa  918    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  35.43 
 
 
402 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  32.41 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.75 
 
 
426 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  33.55 
 
 
459 aa  206  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3794  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.57 
 
 
473 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  40.15 
 
 
548 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1535  sugar transferase  40 
 
 
469 aa  203  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1030  sugar transferase  37.85 
 
 
494 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  32.89 
 
 
459 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  37.12 
 
 
453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  40.14 
 
 
469 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0107  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.25 
 
 
449 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.6 
 
 
484 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2496  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  36.04 
 
 
464 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  47.15 
 
 
461 aa  193  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  36.13 
 
 
458 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  40.89 
 
 
448 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12388  sugar transferase  30.77 
 
 
464 aa  192  9e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  34.94 
 
 
447 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.53 
 
 
463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2614  sugar transferase  34.77 
 
 
465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560673  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  35.24 
 
 
443 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  46.81 
 
 
329 aa  186  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  46.81 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.81 
 
 
346 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.49 
 
 
450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  49.21 
 
 
242 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.41 
 
 
465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0948  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  46.56 
 
 
462 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0841997  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  33.14 
 
 
483 aa  183  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  47.37 
 
 
460 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1661  sugar transferase  40.43 
 
 
470 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  36.54 
 
 
494 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  30.43 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.96 
 
 
477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  33.98 
 
 
465 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  48.17 
 
 
436 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  46.32 
 
 
460 aa  180  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0131  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  48 
 
 
469 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3245  sugar transferase  46.03 
 
 
437 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2647  sugar transferase  31.51 
 
 
463 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00209327  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3439  sugar transferase  36.86 
 
 
462 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248565  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36 
 
 
469 aa  176  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2733  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  30.56 
 
 
463 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  34.86 
 
 
464 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2718  sugar transferase  45.07 
 
 
441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0813786  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2413  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.09 
 
 
427 aa  173  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000393104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2476  sugar transferase  39.67 
 
 
366 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0247717  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2747  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.56 
 
 
459 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0373385  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.6 
 
 
231 aa  169  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  31.05 
 
 
457 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2598  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.03 
 
 
437 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2828  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.17 
 
 
302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2049  sugar transferase  38.77 
 
 
467 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  42.44 
 
 
466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5023  sugar transferase domain-containing protein  38.11 
 
 
467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1171  sugar transferase  44.16 
 
 
470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0583  sugar transferase  29.24 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5394  glucosyltransferase EpsB  45.7 
 
 
219 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.059806  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  28.98 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1711  sugar transferase  46.35 
 
 
475 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.36 
 
 
212 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0669  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  47.57 
 
 
448 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000381309 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  41.3 
 
 
329 aa  160  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  40.84 
 
 
212 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  40.84 
 
 
212 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  40.84 
 
 
212 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.71 
 
 
477 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.3 
 
 
448 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0295  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.74 
 
 
408 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  37.16 
 
 
432 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02598  sugar transferase domain protein  46.7 
 
 
470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.33 
 
 
463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.09 
 
 
475 aa  156  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0743  sugar transferase  44.79 
 
 
437 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0296  sugar transferase  30.59 
 
 
408 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0046  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.1 
 
 
456 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0402  sugar transferase  36.78 
 
 
310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.15 
 
 
476 aa  153  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1735  sugar transferase  37.02 
 
 
306 aa  153  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.94 
 
 
471 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.09 
 
 
470 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1648  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43.37 
 
 
212 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1964  sugar transferase  44.19 
 
 
468 aa  150  6e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3697  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43.37 
 
 
212 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0929  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.34 
 
 
426 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.509222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0115  sugar transferase  39.47 
 
 
194 aa  149  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  39.47 
 
 
230 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25451  sugar transferase  47.34 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0671  sugar transferase  40 
 
 
415 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.33 
 
 
461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2726  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.76 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003543  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  43.07 
 
 
212 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2671  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.15 
 
 
479 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.85 
 
 
461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02218  hypothetical protein  41.92 
 
 
225 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3108  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.14 
 
 
229 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0519  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  37.37 
 
 
311 aa  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0995  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.33 
 
 
477 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>