More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1768 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  97.82 
 
 
459 aa  921    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  100 
 
 
459 aa  939    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  51.22 
 
 
454 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  55.91 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  50.11 
 
 
453 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2476  sugar transferase  61.75 
 
 
366 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0247717  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  52.81 
 
 
447 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  48.61 
 
 
458 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  58.27 
 
 
548 aa  340  4e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  49.55 
 
 
465 aa  319  7e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  50.15 
 
 
443 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  42.9 
 
 
483 aa  316  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  50.15 
 
 
461 aa  315  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  43.32 
 
 
464 aa  315  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2496  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  42.07 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.17 
 
 
463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.17 
 
 
469 aa  300  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1535  sugar transferase  41.58 
 
 
469 aa  298  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.04 
 
 
484 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  45.71 
 
 
460 aa  293  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2049  sugar transferase  44.2 
 
 
467 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.36 
 
 
465 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1661  sugar transferase  43.69 
 
 
470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0131  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.27 
 
 
469 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0948  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  43.09 
 
 
462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0841997  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0583  sugar transferase  42.71 
 
 
470 aa  286  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  43.8 
 
 
469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  45.71 
 
 
460 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3439  sugar transferase  42.51 
 
 
462 aa  283  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248565  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5023  sugar transferase domain-containing protein  43.84 
 
 
467 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1171  sugar transferase  49.43 
 
 
470 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  44 
 
 
448 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0107  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.91 
 
 
449 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02598  sugar transferase domain protein  42.6 
 
 
470 aa  266  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2647  sugar transferase  39.42 
 
 
463 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00209327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2733  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.44 
 
 
463 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0314913  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  48.33 
 
 
426 aa  249  9e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2614  sugar transferase  40.06 
 
 
465 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560673  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3794  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.6 
 
 
473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1030  sugar transferase  42.02 
 
 
494 aa  239  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  41.29 
 
 
494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12388  sugar transferase  35.91 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2828  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  44.78 
 
 
302 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  59.04 
 
 
346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2747  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.78 
 
 
459 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0373385  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  57.45 
 
 
358 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  57.45 
 
 
329 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  35 
 
 
464 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2413  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.3 
 
 
427 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000393104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  55.33 
 
 
242 aa  221  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  54.5 
 
 
231 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.41 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2189  sugar transferase  33.48 
 
 
452 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  56.28 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  56.28 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  30.4 
 
 
463 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0669  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.59 
 
 
448 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000381309 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0519  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  43.4 
 
 
311 aa  195  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4588  sugar transferase  51.06 
 
 
333 aa  193  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501056  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.1 
 
 
450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  43.83 
 
 
230 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0115  sugar transferase  50.27 
 
 
194 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0743  sugar transferase  36.26 
 
 
437 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  50.78 
 
 
475 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  41.63 
 
 
436 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  29.22 
 
 
457 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.69 
 
 
477 aa  186  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.15 
 
 
471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3177  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  31.47 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0295  sugar transferase  47.74 
 
 
214 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  43.85 
 
 
432 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02218  hypothetical protein  47.12 
 
 
225 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  48.4 
 
 
470 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  48.4 
 
 
476 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5394  glucosyltransferase EpsB  47.59 
 
 
219 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.059806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  43.46 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003543  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  49.75 
 
 
212 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3136  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.2 
 
 
306 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.065759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2718  sugar transferase  42.26 
 
 
441 aa  180  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0813786  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3245  sugar transferase  43.68 
 
 
437 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1711  sugar transferase  37.78 
 
 
475 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.35 
 
 
473 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3537  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.48 
 
 
488 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2271  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.36 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  44.04 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.15 
 
 
501 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1034  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.74 
 
 
490 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25451  sugar transferase  47.64 
 
 
443 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2726  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  47.83 
 
 
451 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0013  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  32.33 
 
 
466 aa  170  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.256638  hitchhiker  0.00934247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.93 
 
 
459 aa  170  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2598  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.68 
 
 
437 aa  169  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1774  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.84 
 
 
483 aa  169  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0296  sugar transferase  45.74 
 
 
408 aa  169  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.46 
 
 
454 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3578  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  29.16 
 
 
512 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0402  sugar transferase  40.87 
 
 
310 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  34.98 
 
 
467 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1539  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.15 
 
 
506 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  43.37 
 
 
212 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>