More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3072 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_3072  sugar transferase  100 
 
 
548 aa  1100    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0690  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  76.87 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81329 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2031  sugar transferase  51.2 
 
 
454 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.096366 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0829  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  54.95 
 
 
447 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2479  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  58.65 
 
 
459 aa  342  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  54.89 
 
 
458 aa  333  5e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  57.04 
 
 
402 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1768  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  58.27 
 
 
459 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2366  sugar transferase  54 
 
 
453 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2476  sugar transferase  56.58 
 
 
366 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0247717  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  46.84 
 
 
463 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  51.11 
 
 
484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0159  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  48.72 
 
 
465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  44 
 
 
464 aa  282  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  45.25 
 
 
460 aa  279  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2496  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  48.36 
 
 
464 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3102  sugar transferase  48.58 
 
 
483 aa  277  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0131  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  46.48 
 
 
469 aa  277  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3510  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.51 
 
 
469 aa  276  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1535  sugar transferase  47.65 
 
 
469 aa  272  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  47.76 
 
 
461 aa  270  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3439  sugar transferase  49.82 
 
 
462 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248565  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  47.1 
 
 
465 aa  266  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0702  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  48.7 
 
 
460 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1661  sugar transferase  46.28 
 
 
470 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1171  sugar transferase  47.62 
 
 
470 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5023  sugar transferase domain-containing protein  45.39 
 
 
467 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0948  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  49.03 
 
 
462 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0841997  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02598  sugar transferase domain protein  48.47 
 
 
470 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0107  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.06 
 
 
449 aa  251  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2655  sugar transferase  50.2 
 
 
448 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2390  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.5 
 
 
426 aa  242  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2049  sugar transferase  47.06 
 
 
467 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1046  sugar transferase  43.37 
 
 
469 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1030  sugar transferase  45.21 
 
 
494 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0402  sugar transferase  44.85 
 
 
494 aa  236  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597497  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2614  sugar transferase  45.52 
 
 
465 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560673  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0583  sugar transferase  45.87 
 
 
470 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2647  sugar transferase  46.24 
 
 
463 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00209327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12388  sugar transferase  37.54 
 
 
464 aa  224  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2733  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.86 
 
 
463 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0314913  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2828  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.77 
 
 
302 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  55.61 
 
 
242 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3794  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.5 
 
 
473 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.71 
 
 
477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.12 
 
 
346 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  46.63 
 
 
358 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2413  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  33.33 
 
 
427 aa  210  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000393104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  46.15 
 
 
329 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2747  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.66 
 
 
459 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0373385  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  46.19 
 
 
464 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2189  sugar transferase  40.15 
 
 
452 aa  204  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  48.26 
 
 
231 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  55.68 
 
 
450 aa  194  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4588  sugar transferase  36.88 
 
 
333 aa  193  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501056  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1436  sugar transferase  49.74 
 
 
329 aa  193  9e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  43.7 
 
 
436 aa  193  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  49.74 
 
 
448 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0519  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  38.85 
 
 
311 aa  192  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  51.1 
 
 
471 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0669  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  53.48 
 
 
448 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000381309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2718  sugar transferase  43.98 
 
 
441 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0813786  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5394  glucosyltransferase EpsB  46.84 
 
 
219 aa  188  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.059806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0743  sugar transferase  41.49 
 
 
437 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  46.84 
 
 
230 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0115  sugar transferase  46.84 
 
 
194 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  44.15 
 
 
466 aa  180  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3245  sugar transferase  46.63 
 
 
437 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  38.42 
 
 
432 aa  177  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  32.3 
 
 
463 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  41.41 
 
 
212 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.11 
 
 
212 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  41.41 
 
 
212 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  41.41 
 
 
212 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.77 
 
 
475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003543  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  44.88 
 
 
212 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1964  sugar transferase  47.95 
 
 
468 aa  173  6.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0402  sugar transferase  36.4 
 
 
310 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02218  hypothetical protein  43.72 
 
 
225 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2598  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  46.11 
 
 
437 aa  171  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.81 
 
 
473 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1950  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.16 
 
 
470 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.756109  normal  0.76803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  46.63 
 
 
477 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2948  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.16 
 
 
476 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1648  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  45.56 
 
 
212 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1711  sugar transferase  40.83 
 
 
475 aa  167  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1681  sugar transferase  47.42 
 
 
525 aa  167  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.895795  normal  0.0521671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1796  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  49.16 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25451  sugar transferase  46.84 
 
 
443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3697  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  44.97 
 
 
212 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3578  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.43 
 
 
512 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0295  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.22 
 
 
408 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3524  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  47.09 
 
 
470 aa  164  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000171122  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1979  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  45.5 
 
 
457 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0296  sugar transferase  38.73 
 
 
408 aa  163  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.8 
 
 
459 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2726  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  46.56 
 
 
451 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0295  sugar transferase  41.62 
 
 
214 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.199839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2271  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.83 
 
 
453 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  35.11 
 
 
457 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>